数据分析
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闲看庭前雪
热爱学习,热爱科研,热爱学习的大雪人,用爱来爱每一个爱我的人,用心去做每一件值得用心去做的事。
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标准化处理数据和panda读取excel数据,保存数据
标准化处理数据和panda读取excel数据,保存数据项目场景:提示:标准化处理数据和panda读取数据代码:标准化处理数据def standardization(data):#标准化 mu = np.mean(data, axis=1).reshape(-1,1)#axis=1按行取平均值,reshape让数据能够广播 sigma = np.std(data, axis=1).reshape(-1,1)#std poor = np.subtract(data, mu)原创 2021-06-05 11:22:43 · 384 阅读 · 0 评论 -
GWAS处理流程(全基因组关联分析)——对从ADNI数据库下载的SNP数据及进行质控(QC)
对从ADNI数据库下载的SNP数据及进行质控(QC)简介一、先查看数据中的个体和SNP缺失情况1.查看2.生成绘图以可视化缺失结果。二、QC第一步:删除缺失度大于某个数值的SNP和个体1.删除SNP2.删除个体3.重复1操作4.重复2操作三、QC第二步:检查性别(非必要步骤)1.检查性别2.可视化结果3.以下两个脚本可用于处理性别差异的个体。(可选,但是我没做)1.删除存在性别差异的个体1)找出并生成相应文本2)根据文本删除个体数据2.修改 input-sex四、QC第三步:最小等位基因频率(MAF)定义:原创 2021-01-27 12:00:20 · 8676 阅读 · 17 评论 -
知识小结------数据分析------Bonferroni correction(邦费罗尼校正)
系列文章目录Cox比例风险回归模型(proportional hazards model)知识小结------数据分析------Fisher‘s exact test(费希尔检测)Bonferroni correction(邦费罗尼校正)系列文章目录前言一、Bonferroni correction(邦费罗尼校正)是什么?二、储备知识1.零假设与备择假设2.型一错误,型二错误三、原理与公式1.我看到了一处非常好的讲解2.累积Ⅰ类错误的概率为α'3.Bonferroni法总结前言https:原创 2020-12-31 12:04:19 · 14952 阅读 · 1 评论 -
知识小结------数据分析------Fisher‘s exact test(费希尔检测)
系列知识小结目录Cox比例风险回归模型(proportional hazards model)Fisher's exact test费希尔检测系列知识小结目录前言一、Fisher's exact test费希尔检测是什么?二、原理与公式1.适用范围和目的2.公式的应用1.进行假设2.运用公式求概率P值3.评估总结前言这里记录了我在学习过程学到的一些统计学知识有哪些不对的地方,希望大家能够多多批评和指正。资料大部分来自维基百科,部分是我个人的理解。一、Fisher’s exact te原创 2020-12-31 10:46:35 · 15721 阅读 · 1 评论 -
知识小结------数据分析------Cox比例风险回归模型(proportional hazards model)
知识小结------数据分析------Cox比例风险回归模型(proportional hazards model)学习知识点:学习内容:1.公式2.各项解释3.作用与意义学习知识点:Cox比例风险回归模型(proportional hazards model)在翻阅论文时看到,所以去查阅了相关资料,做了总结。虽然过于简陋,但是都是我个人的理解。学习内容:1.公式2.各项解释X:客观因素,由m个组成X:客观因素,由m个影响因素组成: X=(X_1,X_2,…,X_m)在患者预后实验中原创 2020-12-26 11:18:23 · 3444 阅读 · 0 评论