Lammps之任意表面建模

已于 2023-03-05 11:04:09 修改
阅读量1.9k 收藏 7
点赞数 1
分类专栏： LAMMPS小技巧 Lammps实例教程—In文件详解 文章标签： Lammps lammps
于 2021-10-31 21:07:03 首次发布
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/qq_43689832/article/details/121069975
版权
本文主要介绍了使用LAMMPS进行任意表面建模的相关内容，包括模拟技巧、代码示例和文件下载。此外，还提到了LAMMPS后处理、数据分析以及Ovito渲染教程等进阶主题。
摘要由CSDN通过智能技术生成

关注 M r . m a t e r i a l   , \color{Violet} \rm Mr.material\ , </

了解本专栏 订阅专栏 解锁全文 超级会员免费看
Mr. Material
关注
专栏目录
订阅专栏
LAMMPS生成粗糙表面的in文件脚本（可调节微结构高、长和宽）
Rockyoung
09-29 5429
LAMMPS生成粗糙表面的in文件脚本（可调节微结构高、长和宽）
铝的势函数
05-18
lammps 势函数 reax，描述了铝原子与其他原子的相互作用
lammps建模——EMC
weixin_51982763的博客
07-20 3795
使用python调用EMC（增强蒙特卡洛），自动生成用于lammps的data文件。
实验电镜距离测量之Matlab处理
Rockyoung
06-29 597
在拍摄电竞的时候，我们通常会对图片进行处理，比如，测量距离等等。那么如何根据现有图片结果，快速测量呢？
在lammps模拟过程中的常用势函数设置
热门推荐
qq_44963682的博客
09-25 3万+
在lammps模拟中，势函数的使用必不可少。如何选择合适的势函数？如何设置势函数？这对初学者来说较为困难，本文介绍在lammps模拟中常用的势函数如何使用，希望能够帮助初学者加深对势函数的了解。
lammps教程：官方自带eam_database程序拟合EAM势方法介绍
lammps_jiayou的博客
05-16 3404
使用lammps模拟金属体系，最常用的势函数为eam、meam势。 对于大多数金属或者合金来说，可以从网上下载相对应的eam或meam势力场文件。 而对于一些新的合金材料，可能就找不到相对应的力场文件。 解决的方法有两种，一是采用混合势（pair_style hybrid），第二种方法是自己拟合势函数文件。 混合势的写法在前面文章中已经介绍过，本文介绍一种拟合EAM势的方法。 该方法是运行Xiaowang Zhou编写的一个拟合程序，该程序可自动生成所需要的合金势。 这个程序能够拟合的合金元素有： Cu,
lammps模拟技巧：高熵合金势函数设置三种方法
lammps_jiayou的博客
10-06 7645
大家好，我是小马老师。 本文继续介绍lammps模拟中的势函数设置方法。 在前面的文章中，介绍过高熵合金的建模：高熵合金建模 高熵合金包含的原子数较多，势函数的设置相对复杂，在平时一对一的咨询中，这种问题也相对较多。 下面介绍三种高熵合金势函数设置方法。 1.下载专用势函数 下面的网站包含了大多数原子的势函数： https://www.ctcms.nist.gov/potentials/ 如需下载包含Fe原子的势函数，直接点Fe： 出现势函数列表： 比如Al-Co-Cr-Fe-Ni就是高熵合金AlCoC
LAMMPS常用建模方法总结.rar_lammps_lammps 建模_lammps如何建模_lammps建模_lammps怎么
09-23
下面将详细讨论LAMMPS中的两种主要建模方法——内部建模和外部建模。 内部建模，顾名思义，是指直接在LAMMPS内部进行分子系统的构建。这种方法通常包括以下步骤： 1. **原子类型定义**：根据物质的化学成分，定义...
LAMMPS切削自动建模_lammps切削_lammps_切削
09-11
在标题和描述中提到的“LAMMPS切削自动建模”是指利用LAMMPS进行材料切削过程的模拟。在材料科学和工程领域，模拟切削过程对于理解和优化加工工艺、预测刀具磨损和工件变形具有重要意义。 在LAMMPS中进行切削模拟，...
4_表面能_表面_lammps_lammps实例_
09-29
标题 "4_表面能_表面_lammps_lammps实例_" 暗示了这是一个关于使用LAMMPS（Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator）软件进行金属表面能计算的教程，特别是针对铜（Cu）和镁（Mg）这两种元素。...
Matlab课程作业 3d打印
11-04
3D-print-code MATLAB课程作业，仅供学习使用 半边数据结构 利用半边数据结构处理3D模型中的点面信息。 支撑生成 包含树状支撑以及柱状支撑生成两种支撑 GUI界面 同学自制MATLAB的GUI界面，包含所使用的所有函数
分子动力学模拟lammps 粘度、表面张力分析in文件
12-23
在粘度和表面张力的分析中，IN文件可能包含特定的计算命令，如`compute viscosity`和`compute tension`，以及与之相关的参数设置。 **总结** 通过LAMMPS的IN文件，我们可以对分子系统进行详细的粘度和表面张力分析...
多晶建模_lammps_多晶_matlab_多晶matlab
09-10
标签"lammps"、"多晶"和"多晶matlab"进一步强调了LAMMPS在多晶建模中的应用，以及MATLAB在生成LAMMPS输入文件中的作用。"多晶matlab"这个标签特别突出了使用MATLAB进行多晶建模的独特性。 文件列表中的"多晶建模...
LAMMPS实现甲烷与水的竞争吸附-循环不同气体分子(Matlab)
CyberLynxO的博客
09-11 499
您可以从LAMMPS官方网站（https://lammps.sandia.gov/）下载最新版本的LAMMPS，并按照官方文档中的说明进行安装。在本文中，我们将介绍如何使用LAMMPS和Matlab来实现甲烷和水分子之间的竞争吸附，并模拟循环不同气体分子的过程。希望这篇文章和提供的源代码能够帮助您理解如何使用LAMMPS和Matlab来实现甲烷与水分子的竞争吸附，并模拟循环不同气体分子的过程。如果您有任何问题，请随时提问。通过上述代码，我们可以将LAMMPS模拟的温度和势能随时间的变化进行可视化分析。
LAMMPS模拟：甲烷与水的竞争吸附及循环（Matlab实现）
ByteWhiz的博客
08-06 1127
循环模拟是指将模拟系统的输出作为下一个模拟的输入，从而实现多次模拟的自动化。通过循环模拟，我们可以更好地理解甲烷和水分子在表面上的竞争吸附行为，并预测其在实际应用中的性能。在本研究中，我们将结合Matlab和LAMMPS来模拟甲烷和水分子在表面上的吸附过程。本文介绍了如何使用LAMMPS和Matlab实现甲烷和水分子的竞争吸附以及循环过程的模拟。首先，我们需要定义模拟系统的结构。通过本文的方法，我们可以更好地理解甲烷和水分子的竞争吸附行为，为材料科学和化学领域的相关研究提供有益的参考和指导。
lammps教程：润湿吸附等粗糙界面建模技巧
lammps_jiayou的博客
01-30 1113
粗糙界面建模方法有很多，在之前的推文中也介绍过几种方法，本文介绍另外一种方法。
LAMMPS模拟：液滴撞击疏水石墨烯表面（Matlab实现）
git_database727的博客
09-18 294
LAMMPS是一种用于原子和分子模拟的开源软件包，它能够模拟大规模的粒子系统，并提供丰富的功能和灵活性。通过调整模拟参数和相互作用势函数，您可以探索不同条件下的液滴行为和与石墨烯表面的相互作用。在Matlab中运行上述代码后，它将生成一个名为"lammps_input.in"的输入文件，并调用LAMMPS执行模拟。模拟完成后，将生成一个名为"data.lammps"的输出文件，其中包含模拟结果。以上是一个基本的液滴撞击疏水石墨烯表面模拟的示例，您可以根据自己的需求进行进一步的修改和扩展。
lammps案例：金属液滴润湿模拟案例
lammps_jiayou的博客
05-02 3006
大家好，我是小马老师。 本文分析lammps模拟金属液滴润湿的案例代码。 在之前的推文中，介绍过铜界面润湿水的案例，最近一段时间，不少粉丝朋友咨询金属液滴的润湿，润湿原理差不多，本文以Cu液滴在SiC基底上的润湿为例，介绍金属液滴润湿案例模拟方法。 以此案例为基础，可以模拟其它金属液滴的润湿，替换模型和力场参数即可。 1.建模 SiC的建模方法有很多，可以下载sic.cif文件，导入ms或atomsk中进行正交化和扩胞，转成data文件即可。Cu液滴可以在SiC建模时同时建立，也可以在in文件中导入SiC
LAMMPS中的GCMC（巨正则蒙特卡洛）
Rockyoung
07-19 9530
谈谈LAMMPS中的GCMC（巨正则蒙特卡洛） 记录学习心得（2020.2.21） 疫情期间，还是在家专心科研，养成好习惯，继续记录。 Example ：fix ID group-ID gcmc N X M type seed T mu displace keyword values N：每N步进行一次MC操作，每次操作进行 X 次的交换和 M 次的移动和旋转； type： 原子type； See...
python lammps建模
最新发布
10-08
在Python中，LAMMPS（Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator）是一个广泛使用的分子动力学模拟软件，用于研究材料的微观行为。虽然LAMMPS本身是用C++编写的，但是通过Python接口可以方便地控制和脚本化LAMMPS的工作流程。 Python与LAMMPS的交互通常依赖于第三方库如`lmpython`、`lammps-py` 或者 `pylearn-lammps`。这些库允许你在Python环境中创建和修改系统结构，设置模拟参数，运行模拟，并读取结果数据。 以下是一个简单的步骤概述： 1. 安装必要的库：首先需要安装LAMMPS和相应的Python接口。例如，你可以从官方网站下载并安装LAMMPS，然后使用pip安装Python库。 2. 创建模拟环境：在Python中导入相应的模块，初始化一个LAMMPS实例，并设置基本的模拟参数，如单位、温度等。 ```python from lmpython import LAMMPS lmp = LAMMPS() lmp.units("real") ``` 3. 构造模型：创建原子结构，比如定义原子类型、坐标等。 ```python atoms = lmp.read_data_file("initial_structure.data") ``` 4. 运行模拟：配置模拟类型（如NVT、NVE等），设置时间步长，然后开始运行。 ```python lmp.run(steps=1000) ``` 5. 数据分析：获取和处理模拟过程中的数据，如能量、位置、速度等。 ```python energy = lmp.get_variable("Potential Energy") positions = lmp.get_coordinates() ```
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包

打赏作者

Mr. Material

你的鼓励将是我创作的最大动力

¥1 ¥2 ¥4 ¥6 ¥10 ¥20
扫码支付：¥1
获取中
扫码支付

您的余额不足，请更换扫码支付或充值

打赏作者

实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值