openstructure镜像拉取及使用

openstructure介绍

是一个计算各种蛋白和小分子参数的工具。openstructure链接: link

拉取容器

sudo docker pull registry.scicore.unibas.ch/schwede/openstructure:latest  

一般情况都要sudo权限

创建容器

sudo docker run -it -v /home/xxx/temp/all_dataprocess/my_ost:/root/share  --name my_ost  registry.scicore.unibas.ch/schwede/openstructure 

registry.scicore.unibas.ch/schwede/openstructure是拉取的镜像的名字。

/root/share 是容器内的共享的文件夹

/home/xxx/temp/all_dataprocess/my_ost是本地的共享文件夹

-it 可以交互

开启容器

sudo docker start my_ost

进入容器

sudo docker exec -it my_ost /bin/bash

测试是否创建成功

使用opensource的测试脚本进行测试，结果如下：

关闭容器

sudo docker stop my_ost

删除容器

sudo docker rm my_ost

查看容器

sudo docker ps -a