使用CAT对MRI数据进行预处理

数据：
选取ADNI上MRI数据集

要求：
使用CAT12工具箱中的标准步骤对数据进行预处理

1，偏差矫正biased-corrected;
2,分割成灰质(gray matter)、白质(white matter)、脑脊液(cerebrospinalfluid)
3,使用序列线性（仿射）变换注册到Monurological Institute(MNI) space
4,将灰质图像重新切片为2mm x 2mm x 2mm，得到91 x 109 x 91的尺寸。

配置环境：
系统环境：win10
软件环境：
1，matlab r2020b，由于之前没有安装matlab，为了尽快做完数据的预处理，这里安装的是matlab的试用版；
2，SPM12(https://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/)
3，CAT12((http://dbm.neuro.uni-jena.de/cat12/)

安装
step1:下载spm12和cat12压缩包，解压后，将cat12文件夹放入spm12/toolbox/下；
step2：打开matlab，点击“设置路径”，将spm12路径添加进去；

step3：在命令行输入spm，回车，得到如下页面：

点击fMRI，

点击Toolbox，选择cat12。

点击Segment，得到：

step4：进入上述页面后，首先点击Volumes，选择待处理的图片；Split job into separate process可以选择使用几个线程；

step5：最后点击左上方的绿色三角运行，耐心等待即可。

参考：
https://blog.csdn.net/qq_29300341/article/details/102458323
https://blog.csdn.net/sophia2023/article/details/109025806