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RSS订阅原创 问题：raw.githubusercontent无法访问
hosts：一个没有扩展名的系统文件，主要作用是定义IP地址和主机名的映射关系。作用方式：当用户在浏览器中输入一个需要登录的网址时，系统会首先自动从hosts文件中寻找对应的IP地址，一旦找到，浏览器会立即打开对应网页，如果没有找到，则浏览器会将网址提交DNS服务器进行IP地址解析。文件格式ip地址 + 空格 + 域名 ，比如 140.82.114.4 github.com。
2025-04-23 16:38:50
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原创 生物信息学——三代测序数据：Pacbio
受限于技术力问题，面对基因组长达数百万乃至数十亿个碱基，目前很难对完整的基因组进行测序。于是研究人员尝试利用小片段重构基因组序列信息。根据不同的测序仪，将基因组碎片化为合适的大小，然后才能进行实际的测序、重组和分析。基于它们的底层化学和所分析的DNA片段的长度，测序仪可以分为长读长和短读长两种类型。长读长测序检测长度为1,000到20,000个碱基或更长的DNA（或RNA）片段。无需经过扩增，可以直接对提取后的基因测序。短读长测序多数只能检测50-300个碱基长度的片段。
2024-10-23 21:49:13
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原创 Linux实操——salmon报错：error while loading shared libraries: libboost_iostreams.so.1.60.0
生物信息学实操——salmon报错：error while loading shared libraries: libboost_iostreams.so.1.60.0。
2024-07-10 09:50:56
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原创 R语言实操记录——R包无法安装，报错：Warning in system(cmd) : ‘make‘ not found
R语言实操记录——R包无法安装，报错：Warning in system(cmd) : ‘make‘ not found。
2023-11-27 22:11:34
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原创 R语言——报错：Error in (function (classes, fdef, mtable)：函数‘select’标签‘“data.frame“’找不到继承方法
R语言——报错：Error in (function (classes, fdef, mtable)：函数‘select’标签‘“data.frame”’找不到继承方法。
2023-10-23 16:08:58
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原创 生物信息学——文件格式 pileup详解
每一种生物软件都有固定的文件格式要求。了解文件格式才能快速分辨文件的功能。从某种意义上来说，生物信息分析的过程就是进行各种文件格式的转换过程。
2023-10-18 08:38:57
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原创 R语言R包详解——stringr包：字符处理
函数功能str_c字符串拼接str_trim去掉字符串的空格和TAB(\t)str_pad补充字符串的长度str_dup复制字符串str_wrap控制字符串输出格式str_sub截取字符串str_subset返回匹配的字符串word从文本中提取单词str_count字符串计数str_length字符串长度str_sort字符串值排序str_order字符串索引排序，规则同str_sortstr_split字符串分割字符串分割，同str_split。
2023-10-10 22:37:22
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原创 生物信息学——常见的四种文件格式(fasta,fastq,sam,vcf)
每一种生物软件都有固定的文件格式要求。了解文件格式才能快速分辨文件的功能。从某种意义上来说，生物信息分析的过程就是进行各种文件格式的转换过程。例如当前很多分析都可以概括为从fastq到bam，从bam到vcf的过程。
2023-10-06 11:58:33
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原创 Python3学习笔记——第一章：基础入门
讲几个对编程有用的点Python 是一种高级编程语言，它具有以下特点：易学易用：Python 是开源的，其具有简洁的语法，清晰的语言结构，和相对较少的关键字。Python 的代码可读性强，代码块使用缩进来表示，这使得代码结构更加清晰。无编译环节：Python 是一种解释型语言， 这意味着开发过程中没有了编译这个环节。类似于PHP和Perl语言。跨平台性：Python 可以在多个操作系统上运行，包括Windows、macOS、Linux等，因此具有很强的跨平台性。多用途。
2023-10-02 19:03:05
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原创 Python——ASCII编码与Unicode（UTF-8，UTF-16 和 UTF-32）编码
Python——ASCII编码与Unicode（UTF-8，UTF-16 和 UTF-32）编码。
2023-10-02 17:47:17
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原创 机器学习学习笔记——第二章：模型评估与选择
介绍了一下如何获得一个符合需求的学习模型，涉及到一些名词解释，例如经验误差，泛化误差，过拟合，欠拟合等，获得一个好的学习模型，需要经过评估方法，性能度量，比较检验获得。
2023-07-14 17:12:00
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原创 生物信息学——常见的OrgDB包
物种OrgDB人（Humanm)org.Hs.eg.db小鼠（Mouse）org.Mm.eg.db猪（Pig)org.Ss.eg.db按蚊（Anopheles）org.Ag.eg.db拟南芥（Arabidopsis）org.At.tair.db牛（Brovine)org.Bt.eg.db蠕虫（Worm）org.Ce.eg.db犬（Canine）org.Cf.eg.db苍蝇（Fly)org.Dm.eg.db斑马鱼（Ze
2023-06-20 15:48:46
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原创 R语言学习笔记——扩展篇：第十九章-使用ggplot2进行高级绘图
具体介绍如何利用ggplot2包作图，包括用几何函数指定图的类型，分组（重叠图形），刻面（并排图形），添加光滑曲线，修改ggplot2图形的外观（坐标轴，图例，标尺，主题，多重图，颜色集），保存图形。
2022-12-20 15:32:01
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原创 R语言学习笔记——高级篇：第十四章-主成分分析和因子分析
详细介绍了主成分分析（PCA）和因子分析（EFA）的流程。1、判断主成分（因子）的个数2、提取主成分（因子）3、主成分（因子）旋转4、获取主成分（因子）得分
2022-12-18 21:31:59
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原创 R语言学习笔记——基础篇：第六章-基本图形
展示单类别型或连续型变量的分布情况的绘图方法。包括：条形图，饼图，直方图，核密度图（叠加的核密度图），箱线图（并列箱线图，小提琴图），轴须图，点图的绘制方法
2022-12-11 18:43:47
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原创 R语言学习笔记——入门篇：第五章-高级数据管理
本章总结了用于处理数据的数学，统计，概率以及一些列常用函数。总结了循环语句（for，while）与条件语句（if-else，ifelse，switch）。总结了折叠，整合，重构数据的多种方法。
2022-12-07 16:30:49
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原创 R语言学习笔记——入门篇：第四章-基本数据管理
基本的数据管理操作，包含了创建新变量，变量的重命名与重编码，对缺失值，日期值的操作，对数据类型进行转化，对数据进行排序，对数据集进行合并，取子集的操作等
2022-12-04 22:01:18
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原创 R语言实操记录——获取包的三种渠道及安装包的三种方式
一、获取包的三种渠道二、安装包的三种方式2.1、CRAN2.2、Bioconductor2.3、Github
2022-11-09 10:52:05
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原创 Python——Python程序的文件头部声明
Python文件头部声明：#!/usr/bin/env python# coding=utf-8
2022-11-03 15:51:06
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原创 Python——报错：ImportError: No module named ***
Python——报错：ImportError: No module named ***
2022-11-02 22:37:04
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原创 R语言学习笔记——入门篇：第三章-图形初阶
基础绘图函数：plot( ）图形控制函数：dev( ）直方图函数：hist( )，低级绘图函数：用来修饰图形，图形参数（符号与线条，颜色，文本属性，图形与边界尺寸），添加标题，自定义坐标轴，图例，次要刻度线和网格线，图形的组合（par( )函数，layout( )函数），图形布局的精细控制
2022-10-29 20:10:12
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原创 R语言学习笔记——入门篇：第二章-创建数据集
数据集的概念，数据结构（向量，矩阵，数组，数据框（attach( )，detach( )，with( )），因子，列表），数据的输入三、数据的输入（R内置的文本编辑器，代码中嵌套数据，导入带分隔符的文本数据（.txt, .csv），Excel，XML，网页抓取，SPSS，SAS，Stata，NetCDF数据），数据集的标注，函数总结。
2022-10-26 23:16:45
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原创 R语言学习笔记——入门篇：第一章-R语言介绍
R语言简介，R软件的安装（Windows/Mac，Linux/Unix）RStudio的安装，R语言的基本操作，R语言中的赋值（= 与
2022-10-24 20:38:43
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原创 Linux7.6—Shell编程 学习笔记 第三章：Shell高级进阶
Shell运算符（算数运算符，关系运算符，布尔（逻辑）运算符，短路运算符，字符串运算符，文件测试运算符），命令解析（``,$()），（）、[]、{}、（（））、[[]]等各种括号的使用，逻辑运算，算数运算，短路运算的区别，echo打印数据，test命令，Shell流程控制（if，case，for，while，break，continue），Shell自定义函数。
2022-08-31 21:40:20
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原创 Linux7.6 学习笔记 第十章：Linux的软件安装
Linux的软件安装，查找与配置Linux中的环境变量，软件的两种安装方式（RPM（安装包）安装以jdk8为例，压缩包解压安装（tar.gz）以Tomcat为例）Yum安装的作用与相关命令，更换yum源，wget命令详解，Mysql数据库的安装。
2022-08-13 15:36:20
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生物信息学专业，GEO数据库挖掘进行ID转换时，常用的GPL平台对应的BIOconductor的R包总结
2023-02-09
Linux-CentOS 7.6 系统初始化脚本
2022-09-19
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