Linux下无GUI配置DGL环境

Linux下无GUI配置DGL环境

1.使用python查看python的版本，按照对应版本到官网中找到对应的anaconda版本。历代版本下载链接Index of / (anaconda.com)

2.复制下载链接，使用wget指令下载到指定的文件夹下：例如下载到/home/Downloads文件夹下

wget [下载链接] -O /home/Downloads/ 

# 如果cannot found wget
sudo apt-get update  # 同步更新一下以防报错
sudo apt-get install wget # 下载指令

3.使用bash [anaconda的下载文件夹]来安装anaconda

bash /home/Downloads/anaconda3.20xx.xx...  # 可以敲到anaconda的时候tab键补全代码即可

# 之后就一直[enter键]下一步就好了
	#but
	# 在这个过程中，会出现一些询问(大概描述一下)
	# 1. 是否确定下载(yes/no)：输入yes即可
	# 2. 确定下载安装的位置，默认为/home/用户名/anaconda3：如果需要更换安装位置可以直接输入完整的安装位置；否则直接[enter键]安装到默认位置，这个比较推荐
	# 3. 是否需要在安装的时候对anaconda的环境进行初始化：建议yes，这样就不用自己去配置全局变量了。

4.初始化.condarc文件（可能会报conda: command not found的错）

conda config --set show_channel_urls yes

# 如果报错conda: command not found
	source ~/.bashrc # 激活一下anaconda就好了
	# 这个时候你就会发现终端下你每次输入指令的 用户@xx:/$ 变成了 （base）用户@xx：/$ 
	# 这样就不会报错了

5.查看并修改.condarc文件 （可以忽略这步，因为我做了这步后面报错了，可以等到以后必要使用的时候再加镜像）

ls -alh # 查看是否存在.condarc文件

​ 修改文件.condarc文件

vi /.condarc  # 比起vi我更喜欢gedit指令

# PC端
channels:
  - http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
  - http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
  - http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/msys2/
  - http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
  - http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
  - http://mirrors.aliyun.com/anaconda/pkgs/main
  - http://mirrors.aliyun.com/anaconda/pkgs/r
  - http://mirrors.aliyun.com/anaconda/pkgs/msys2
show_channel_urls: true
custom_channels:
  conda-forge: http://mirrors.aliyun.com/anaconda/cloud
  msys2: http://mirrors.aliyun.com/anaconda/cloud
  bioconda: http://mirrors.aliyun.com/anaconda/cloud
  menpo: http://mirrors.aliyun.com/anaconda/cloud
  pytorch: http://mirrors.aliyun.com/anaconda/cloud
  simpleitk: http://mirrors.aliyun.com/anaconda/cloud

# 服务器端
channels:
  - defaults
show_channel_urls: true
channel_alias: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda
default_channels:
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/r
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/pro
  - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/msys2
custom_channels:
  conda-forge: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  msys2: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  bioconda: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  menpo: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  pytorch: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
  simpleitk: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud

6.创建pytorch的虚拟python环境

conda create -n pytorch python=3.8

7.激活安装pytorch环境

conda activate pytorch # enter之后，（base）前缀会变成（pytorch）前缀
conda install pytorch torchvision torchaudio cudatoolkit=11.3 -c pytorch

8.查找conda，查看匹配版本

conda install cudnn=8.2.1

# 如果安装过程中出现failed爆红错误：Solving environment: failed with initial frozen solve. Retrying with flexible solve
# 使用指令更新一下conda就好了
	conda update --prefix [anaconda的安装目录] anaconda # 我等了半小时。。。python库真的好多
	# 其实可以先输入 conda update，他会提示你正确更新的代码，也就是上面这行代码，直接复试粘贴运行就好了。

9.安装dgl并查看

conda install -c dglteam dgl  # https://www.dgl.ai/pages/start.html 官网查找对应的cuda对应的下载代码

# 如果没有改.condarc文件应该就不会有这个报错
# 报错：Collecting package metadata (current_repodata.json): failed
# 	   UnavailableInvalidChannel: HTTP 404 NOT FOUND for channel dglteam
# conda没有给清华源授权，所以服务停止404了，所以需要安装。
	pip install torch torchvision
	
# 报错：CondaHTTPError: HTTP 000 CONNECTION FAILED for url 
# 网络访问超时，继续试。或者改/增加.condarc文件里面的参数如下
	remote_read_timeout_secs: 5000.0 # 代表远程读取时间时长5s 如果还是报000错误可以继续改大一点继续试

10.测试运行

conda activate pytorch # 激活pytorch
python # 进入bash写python代码
import dgl 
# 如果报错：ModuleNotFoundError: No module named 'dgl'
# 1. 按ctrl + D 退出bash
# 2. conda activate base
# 3. pip install dgl
# 4. conda activate pytorch
# 5. pip install dgl 
# 如果在执行pip操作时，一片红或者加载包加载到一边中断，多试几次，可能是网络不稳定

# 再重新进行运行测试，不报错了就继续输入下面的代码
import torch as th
u, v = th.tensor([0, 0, 0, 1]), th.tensor([1, 2, 3, 3]) #u = 出节点集、v = 入节点集合
g = dgl.graph((u, v))
g
# 输出为：
# Graph(num_nodes=4, num_edges=4,
#      ndata_schemes={}
#      edata_schemes={})

# 环境测试完毕，安装成功

参考：如何搭建Pytorch环境（linux版）_computer literacy的博客-CSDN博客_linux pytorch

conda: command not found解决办法_奥特曼熬夜不睡觉的博客-CSDN博客

Linux如何下载文件通过url (baidu.com)

Solving environment: failed with initial frozen solve. Retrying with flexible solve的解决方法_AI浩的博客-CSDN博客