医学图像配准论文学习——仰卧位至俯卧位结肠配准和基于最优传输的可视化（2019）

论文链接：Supine to prone colon registration and visualization based on optimal mass transport - ScienceDirect

虽然是一篇四区的文章，并且是19年的文章。但结肠（colon）配准的论文很稀罕，并且这份工作有独到的地方，在此记录。

注：本文与深度学习的方法无关，属于传统的图像处理方法，可能涉及到较多几何原理，不感兴趣的同学请跳过本文。

摘要

表面的配准和可视化在工程和医疗领域发挥着重要作用。特别是在虚拟结肠镜检查 （VC） 中，仰卧位和俯卧位计算机断层扫描 （CT） 之间的高效和稳健的配准方法是非常可取的，因为它有助于提高息肉检测率。然而，由于结肠形状的严重扭曲，仰卧位和俯卧位结肠配准仍然是一项具有挑战性的任务。在这项工作中，我们提出了一种新的使用最优质量传输（OMT）理论的仰卧位和俯卧位结肠扫描的配准和可视化框架。所提出的新方法能够将结肠表面参数化到平面矩形域上，以实现更好的配准和可视化。此外，我们还开发了结肠壁的新型扁平可视化，使用2D地图中的颜色编码距离变化放大息肉。实验结果验证了所提配准方法的有效性和鲁棒性。

主要方法：

1.保角映射用于将仰卧位和俯卧结肠表面展平为平面矩形表面。

2.基于矩形域的最佳质量传递图（OMT-Map）与仰卧和俯卧表面的设计目标测量密度一起使用。

3.根据扁平折叠分割结果自动提取特征点。

4.引入基于准共形（QC）迭代的Techmüller映射来计算仰卧结肠模型在展开结肠表面上俯卧位模型的配准。

一、方法

本文使用的是基于Brenier方法的最优质量传输图，示意图为：

（有一说一，方法这部分我也看不懂，这没有个三五年研究几何的学习经历哪儿看得懂... ）

这张图说明保角映射的效果，即它可以保持结肠表面上的角度和形状，但不一定保持大小或曲率。保角映射由一个称为保角因子的函数决定，它表示了面积扭曲的程度。图中的颜色编码显示了保角因子的大小，从红色（最大）到蓝色（最小）。

二、配准

在这项工作中，我们使用基于准共形（QC）迭代方法的Teichmüller映射计算仰卧位和俯卧位结肠表面之间的结肠配准。

 

结果：

 

总结

TODO