上海大学计算机体系结构实验四 HPL安装和测试（虚拟机centos7.6环境下保姆级教程！）

【星殒·化尘】

已于 2023-09-11 21:03:31 修改

阅读量3.8k

点赞数 22

文章标签： linux centos 系统架构集成测试

于 2023-05-11 19:00:51 首次发布

本文链接：https://blog.csdn.net/qq_51413628/article/details/130628390

版权

上海大学计算机体系结构实验四 HPL安装和测试（虚拟机centos7.6环境下保姆级教程！）

CSDN上的安装测试有很多，但在实际安装过程中经常碰到博客的教程缺了中间的某个指令，或者漏了某个配置（写的不完全）导致报错的情况，一波三折下来直接心态搞崩，不过好在最后终于是成功了。

特此我详细记录下本次HPL安装和测试的过程，给自己一个参考，也给其他人一个参考。（本过程仅在我的centos7.6虚拟机上安装成功，若有其他报错问题可以评论区告诉我）

一. 实验环境

软件环境：

Linux（CentOS 7.6）
GCC和GFortran（编译器）
BLAS-3.8.0（用来做矩阵计算或者向量计算的库）
CBLAS（是BLAS的C语言接口）
MPICH-3.2.1（用于并行运算的工具）
HPL-2.3。

接下来的安装顺序也是按照BLAS-3.8.0->CBLAS->MPICH-3.2.1->HPL-2.3来进行。

$[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-kvlb0uON-1683801947680)(C:\Users\lv\AppData\Roaming\Typora\typora-user-images\image-20230511160212939.png)]$

二. 环境搭建

1、安装配置GCC和GFortran（这很重要，后面可能有人会出现G77不存在的报错，需要修改为GFortran）

检查环境：

gfortran -v 
gcc -v

安装GCC和Fortran

sudo yum install gcc
sudo yum install gcc-gfortran

接下来的所有安装过程均在用户权限下完成，不要使用su进入root权限进行安装，否则会出现一些奇怪的错误（比如权限问题）

2、下载安装BLAS-3.8.0（用来做矩阵计算或者向量计算的库）

2.1首先进入主目录，一般是/home/(你的usr名称)页面，一般点击下图的主目录即可。

$[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-3TEDXEw2-1683801947680)(C:\Users\lv\AppData\Roaming\Typora\typora-user-images\image-20230511161705624.png)]$

2.2 直接在主目录右键打开终端，通过wget指令联网（虚拟机要能够联网）下载BLAS-3.8.0，然后解压在主目录即可。

wget http://www.netlib.org/blas/blas-3.8.0.tgz
tar -xzf blas-3.8.0.tgz

解压完成后如下图所示会出现两个文件，左边一个是下载的压缩包，右边那个是解压完成后的文件夹

$[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-fAD0HMjx-1683801947681)(C:\Users\lv\AppData\Roaming\Typora\typora-user-images\image-20230511161946776.png)]$

2.3 输入下面两条指令编译生成blas_LINUX.a文件：make命令

在这里插入图片描述

cd BLAS-3.8.0
make

2.4 链接.o文件生成libblas.a文件

ar rv libblas.a *.o

BLAS-3.8.0文件夹下应该能够找到libblas.a文件
在这里插入图片描述

2.5 复制一份blas_LINUX.a和libblas.a库文件到系统/usr/local/lib目录下（后续安装hpl配置环境时需要用到）

sudo cp blas_LINUX.a /usr/local/lib

至此BLAS-3.8.0安装完成

3、安装CBLAS（是BLAS的C语言接口）

3.1 回到主目录右键打开终端，输入指令下载cblas.tgz并解压

$[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-5eT3uIJb-1683801947683)(C:\Users\lv\AppData\Roaming\Typora\typora-user-images\image-20230511163750280.png)]$

wget http://www.netlib.org/blas/blast-forum/cblas.tgz
tar -xzf cblas.tgz

解压完成后主目录出现如下图所示左边一个是下载的压缩包，右边那个是解压完成后的文件夹。

在这里插入图片描述

3.2 进入CBLS文件夹下，使用绝对路径将处于BLAS-3.8.0文件夹下的blas_LINUX.a库文件拷贝到CBLS文件夹下

cd CBLAS
cp /home/ldw(你的用户名称这里我是ldw)/BLAS-3.8.0/blas_LINUX.a ./

3.3 编译CBLS，CBLAS安装目录下的lib目录中产生一个静态链接库文件 cblas_LINUX.

首先将上一步编译成功的 libblas.a 复制到 CBLAS目录下的testing子目录
make命令编译所有的目录
PS:（如果make后报错可以先去执行下一步（3.4）修改Makefile.in文件后再执行make命令）

感谢评论区小伙伴指出问题！

这两句会在CBLAS安装目录下的lib目录中产生一个静态链接库文件 cblas_LINUX.a文件，后需要用到

cp /home/ldw(你的用户名称这里我是ldw)/BLAS-3.8.0/libblas.a  testing   
make

在这里插入图片描述

3.4 修改 Makefile.in 文件中的 BLLIB字段

vim Makefile.in
BLLIB = /home/ldw(你的用户名称这里我是ldw)/BLAS-3.8.0/blas_LINUX.a

修改完成后按ESC，然后输入“：wq”，最后按下回车键进行保存。

$[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-YLUFj2L4-1683801947684)(C:\Users\lv\AppData\Roaming\Typora\typora-user-images\image-20230511164021433.png)]$

3.5 复制一份cblas_LINUX.a库文件到系统/usr/local/lib目录下（后续安装hpl配置环境时需要用到）

sudo cp lib/cblas_LINUX.a /usr/local/lib

/usr/local/lib目录下的文件，（后面两个文件没有也不要紧，如果后面发生了报错，可以从bblas和cblas文件夹下找到，然后复制进去）

$[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-MlLGXRaW-1683801947685)(C:\Users\lv\AppData\Roaming\Typora\typora-user-images\image-20230511165023165.png)]$

3.6 测试运行（hpl安装完成后可以返回进行测试）

后续hpl若配置成功，会在cblas/testing文件夹下出现一些可执行文件，用来测试最终是否成功，hpl配置完成后可以回到此处进行二次检查（有的博客不需要hpl配置完成也会有，我不知道为什么，但是我配置时，安装完成cblas后并没有出现，只有当安装完成hpl才出现，大家根据情况自行测试）。

$[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-FVMNbIDQ-1683801947685)(C:\Users\lv\AppData\Roaming\Typora\typora-user-images\image-20230511164731000.png)]$

挑一个进行测试运行

./testing/xzcblat1

$[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-tsV0mUVo-1683801947686)(C:\Users\lv\AppData\Roaming\Typora\typora-user-images\image-20230511164502212.png)]$

4、安装MPICH-3.2.1（用于并行运算的工具）

4.1 回到主目录右键打开终端，输入指令下载并解压mpich-3.2.1.tar.gz

wget http://www.mpich.org/static/downloads/3.2.1/mpich-3.2.1.tar.gz
tar xzf mpich-3.2.1.tar.gz

解压完成后在主目录下会出现该文件夹

$[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-9KRZXvi2-1683801947686)(C:\Users\lv\AppData\Roaming\Typora\typora-user-images\image-20230511165818866.png)]$

4.2 输入下面两条指令进入mpich文件夹下并设置安装路径

这里的安装路径就是最终真正的安装路径，也是后面环境变量配置的位置。若想安装于其他位置只需要修改prefix=后面的即可，但环境变量也需要同步修改。（已修改，感谢同学指出问题）

cd mpich-3.2.1/
./configure --disable-cxx --prefix=/home/mpich-install 2>&1 | tee c.txt

4.3 编译

make 2>&1 | tee m.txt

4.4 安装

sudo make install 2>&1 | tee mi.txt

4.5 配置环境变量

重要：上面的步骤完成后，我们可以在/home文件夹下看到mpich-install文件夹，这个才是我们mpich真正安装的位置！后续hpl安装配置环境的时候用到的都是/home/mpich-install文件夹作为mpi安装的路径，而不是主目录下的！这一点坑了我好久

$ [外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-6gQmNMqj-1683801947687)(C:\Users\lv\AppData\Roaming\Typora\typora-user-images\image-20230511171349787.png)]$

用vim配置环境同时用source命令重新加载配置

vim ~/.bashrc
export PATH=/home/mpich-install/bin:$PATH
source ~/.bashrc

$[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-U7xDGH2Z-1683801947687)(C:\Users\lv\AppData\Roaming\Typora\typora-user-images\image-20230511171432790.png)]$

4.6 查看前面工作是否成功

若出现mpicc未找到，则可能是上一步配置的环境出现了错误，不要配成/home/ldw(你的用户名称，这里我是ldw)/mpich-3.2.1,这个路径是错误的，不是mpi真正安装的地方，要与安装路径一致，可返回查看4.2

which mpicc && which mpiexec
mkdir machinefile
mpiexec -f machinefile -n 3 hostname && mpiexec -n 5 -f machinefile ./examples/cpi

最后一条指令会出现如下的运行结果

$[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-7fzF9Jwu-1683801947688)(C:\Users\lv\AppData\Roaming\Typora\typora-user-images\image-20230511171603669.png)]$

5、安装HPL-2.3

5.1 查看/usr/local/lib目录下是否存在blas_LINUX.a和cblas_LINUX.a文件，若没有，请仔细阅读上文的步骤2和3的结尾部分，需要复制一份进去。

/usr/local/lib目录下的文件，（后面两个文件没有也不要紧，如果后面发生了报错，可以从bblas和cblas文件夹下找到，然后复制进去）

$[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-5GowGY6r-1683801947688)(C:\Users\lv\AppData\Roaming\Typora\typora-user-images\image-20230511165023165.png)]$

5.2 回到主目录右键打开终端，输入指令下载并解压hpl测试包

wget http://www.netlib.org/benchmark/hpl/hpl-2.3.tar.gz
tar -xzf hpl-2.3.tar.gz

5.3 进入hpl-2.3文件夹，将setup文件夹下的Make.Linux_PII_CBLAS文件复制到hpl-2.3文件夹下(手动进入setup文件夹复制也行)。

cd hpl-2.3/
cp setup/Make.Linux_PII_CBLAS ./

$[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-zkOnUrtV-1683801947689)(C:\Users\lv\AppData\Roaming\Typora\typora-user-images\image-20230511172636667.png)]$

5.4 配置环境参数（这一步极其重要，配错了就GG）

vim Make.Linux_PII_CBLAS

在这里插入图片描述

配置完成后按ESC，然后输入“：wq”，最后按下回车键进行保存。

5.5 编译

make arch=Linux_PII_CBLAS

编译完成后在bin文件夹下会生成一个xhpl文件。

$[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-zC9YB0Ax-1683801947692)(C:\Users\lv\AppData\Roaming\Typora\typora-user-images\image-20230511173843306.png)]$

遇到libmpich.a文件缺少就是因为配置环境时mpich路径输入错误，不是主目录那个，而是/home/mpich-install那个

5.6 运行测试，将测试结果写入到HPL-Benchmark.txt文件中。

cd bin/Linux_PII_CBLAS
mpirun -np 4 ./xhpl > HPL-Benchmark.txt

测试结果文件长这样：

$[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-nHbqJa1j-1683801947693)(C:\Users\lv\AppData\Roaming\Typora\typora-user-images\image-20230511173945847.png)]$

至此hpl安装成功！可以返回到步骤3进行CBLAS的二次测试

三、hpl的测试

3.1 查看cpu详细参数：

cat /proc/cpuinfo

$[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-Bd5NbIbp-1683801947693)(C:\Users\lv\AppData\Roaming\Typora\typora-user-images\image-20230511181428825.png)]$

本虚拟机的逻辑cpu共有4个编号为0、1、2、3，分别属于4个物理cpu，编号分别为1、2、4、6，cpu主频为2894.565mhz(2.894565GHZ),每个cpu有一个核心，AMD的浮点运算单元数=8。
因此，本机器的分值计算速度=2.9GHz * 4 * 8=92.8Gflops

实验书上的描述：

1 修改HPL.dat设置运行参数

在HPL测试中，使用的参数选择与测试的结果有很大的关系。HPL中参数的设定是通过从一个配置文件HPL.dat中读取的，所以在测试前要改写HPL.dat文件，设置需要使用的各种参数，然后再开始运行测试程序。配置文件内容的结构如下：

HPLinpack benchmark input file              //文件头，说明

Innovative Computing Laboratory, University of Tennessee

HPL.out    output file name (if any)         //如果使用文件保留输出结果，设定文件名

6       		device out (6=stdout,7=stderr,file)   //输出方式选择（stdout,stderr或文件）

2     	 		# of problems sizes (N)       //指出要计算的矩阵规格有几种

1960  	2048	Ns                      //每种规格分别的数值

2      			# of NBs               //指出使用几种不同的分块大小

60 80     		NBs                   //分别指出每种大小的具体值

2      			# of process grids (P x Q-l     //指出用几种进程组合方式

2  4     		Ps                 //每对PQ具体的值

2  1   		 	Qs                  

16.0     		threshold              //余数的阈值

1       		# of panel fact           //用几种分解方法

1       		PFACTs (0=left, 1=Crout, 2=Right)  //具体用哪种,0 left,1 crout,2 right

1       		# of recursive stopping criterium  //几种停止递归的判断标准

4       		NBMINs (>= 1)             //具体的标准数值（须不小于1）

1     		  	# of panels in recursion       //递归中用几种分割法

2    		   NDIVs                //这里用一种NDIV值为2，即每次递归分成两块

1     		   # of recursive panel fact.     //用几种递归分解方法

2     		  	RFACTs (0=left, 1=Crout, 2=Right)   //这里每种都用到（左，右，crout分解）

1     		  # of broadcast             //用几种广播方法

3       BCASTs (0=1rg,1=1rM,2=2rg,3=2rM,4=Lng,5=LnM)  //指定具体哪种（有1-ring,1-ring Modified,2-ring,2ring Modified,Long以及long-Modified）

1       # of lookahead depth   //用几种向前看的步数

1       DEPTHs (>=0)       //具体步数值（须大于等于0）

2       SWAP (0=bin-exch,1=long,2=mix) //哪种交换算法（bin-exchange，long或者二者混合）

64      swapping threshold   //采用混合的交换算法时使用的阈值

0       L1 in (0=transposed,1=no-transposed) form   //L1是否用转置形式

0 U  in (0=transposed,1=no-transposed) form  //U是否用转置形式表示

1       Equilibration (0=no,1=yes)        //是否采用平衡状态

8       memory alignment in double (> 0)   //指出程序运行时内存分配中的采用的对齐方式

要得到调试出高的性能，必须考虑内存大小，网络类型以及拓扑结构，调试上面的参数，直到得出最高性能。

  本次实验需要对以下三组参数进行设置：

2       		# of problems sizes (N)        //指出要计算的矩阵规格有几种

1960  2048		Ns                      //每种规格分别的数值指出要计算的矩阵规格有2种，规格是1960，2048

2       		# of NBs               //指出使用几种不同的分块大小

60 80    		 NBs                   //分别指出每种大小的具体值指出使用2种不同的分块大小，大小为60，80

2       		# of process grids (P x Q-l     //指出用几种进程组合方式

2  4    		 Ps                  //每对PQ具体的值

2  1    		Qs   

指出用2种进程组合方式，分别为（p＝2，q=2） 和（p＝4，q=1）

注：p＝2，q=2时需要的进程数是p×q＝2×2＝4，运行时mpirun命令行中指定的进程数必须大于等于4

以上3组每组有两种情况，组合后一共有8种情况，将得到8个性能测试值，经过不断的调试将会得出一个最大的性能值，这就是得到的最高性能值。

  以下是其中一个性能测试值，规格为2048，分块是60，p＝2，q=2时，运行时间为：56.14，运算速度为0.8165 Gflops。PASSED代表结果符合要求。

============================================================================

T/V         N   NB   P   Q        Time       Gflops

\----------------------------------------------------------------------------

W13R2C4     2048  60   2   2        56.14      8.165e-01

\----------------------------------------------------------------------------

||Ax-b||_oo / ( eps * ||A||_1  * N     ) =     0.0175089 ...... PASSED

||Ax-b||_oo / ( eps * ||A||_1  * ||x||_1  ) =     0.0035454 ...... PASSED

||Ax-b||_oo / ( eps * ||A||_oo * ||x||_oo ) =     0.0007503 ...... PASSED

============================================================================

设置参数
在这里插入图片描述

实际运行结果：

以下是其中一个性能测试值，规格为2048，分块是60，p＝2，q=2时，运行时间为：0.30，运算速度为19.137 Gflops。PASSED代表结果符合要求。

$[外链图片转存失败,源站可能有防盗链机制,建议将图片保存下来直接上传(img-QObDhHRl-1683801947693)(C:\Users\lv\AppData\Roaming\Typora\typora-user-images\image-20230511184411153.png)]$

3.2 进行性能测试

峰值速度随进程个数变化
在这里插入图片描述
其他配置不变，改变p、q的数量完成下列测试数据。
p*q=进程数=cpu个数

矩阵规模=1960，分块数量=60的情况下的一组测试，选择所有测试中峰值速度最大的一组填入表格

CPU个数	N	NB	P	Q	Time	Gflops	参与运算主机名
1	1960	60	1	1	0.66	7.6447	Ldw@master
2	1960	60	1	2	0.34	14.800	Ldw@master
3	1960	60	1	3	0.25	20.259	Ldw@master
4	1960	60	2	2	0.2	24.91	Ldw@master

后续还有1960 80、2048 60、2048 80的测试，省略，留给大家自行测试了。。。

3.3 完成上述测试后比较和分析上面的测试结果，特别是如何能够得到高的性能测试值

可以看到，当矩阵规模和分块数一定的情况下，CPU个数和计算峰值速度成正比，CPU个数对计算峰值速度有着巨大的影响，CPU个数越多，计算速度越快。
经过多次测试，分块大小对性能有很大的影响，NB的选择和软硬件许多因素密切相关。当矩阵规模一定的情况下，分块数量的提升不一定能够提升计算速度，在本机上，当矩阵规模N=2048，CPU数量=1时，NB分块数量大约在64左右计算峰值能够取到最大值（7.6797）。分块数量需要通过在小规模数据上不断调试而得出。
经过测试，p，q的选择对于计算峰值也有较大的影响，从上面的测试数据中可以看到，所有的最佳结果都是在p<q的时候取到，经过查阅资料得知，这是因为列通信向量（通信次数和通信数据量）要远大于横向通信造成的，当水平方向处理器数量为2的幂次的时候最优。
因此在测试的时候可以让P=1，Q=n，这样可以在小规模数据时达到最快速度，便于调试出最优的分块大小NB，同时也能够获得高性能的测试值。

参考博客：

https://blog.csdn.net/no1xiaoqianqian/article/details/129223686?spm=1001.2101.3001.6650.1&utm_medium=distribute.pc_relevant.none-task-blog-2%7Edefault%7ECTRLIST%7ERate-1-129223686-blog-51442603.235%5Ev32%5Epc_relevant_increate_t0_download_v2&depth_1-utm_source=distribute.pc_relevant.none-task-blog-2%7Edefault%7ECTRLIST%7ERate-1-129223686-blog-51442603.235%5Ev32%5Epc_relevant_increate_t0_download_v2&utm_relevant_index=2

https://blog.csdn.net/sishuiliunian0710/article/details/20493101?ops_request_misc=%257B%2522request%255Fid%2522%253A%2522168377439916800215023273%2522%252C%2522scm%2522%253A%252220140713.130102334..%2522%257D&request_id=168377439916800215023273&biz_id=0&utm_medium=distribute.pc_search_result.none-task-blog-2~all~sobaiduend~default-2-20493101-null-null.142^v86^control,239^v2^insert_chatgpt&utm_term=%E5%AE%89%E8%A3%85hpl&spm=1018.2226.3001.4187
https://blog.csdn.net/kingdomkitty/article/details/80258364?ops_request_misc=%257B%2522request%255Fid%2522%253A%2522168379618616800192282030%2522%252C%2522scm%2522%253A%252220140713.130102334..%2522%257D&request_id=168379618616800192282030&biz_id=0&utm_medium=distribute.pc_search_result.none-task-blog-2~all~sobaiduend~default-1-80258364-null-null.142^v87^control,239^v2^insert_chatgpt&utm_term=%E5%AE%89%E8%A3%85mpich&spm=1018.2226.3001.4187