WSI图像预处理问题

最新推荐文章于 2024-09-14 19:55:48 发布
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文章标签： python
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版权

有一些疑惑：

1、svs格式的文件如何进行处理？

2、有没有工具能够对病理图片的病变区域进行自动标注，以进行标签分类？

3、我是做的癌症识别的，就是查看svs图片中的癌症属于哪一个具体的癌症，我应该怎么做呀？

新手小白一个，希望有相关经验的大佬可以指点一二，不胜感激！！！

qq_51708215
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探索Python下的WSI预处理利器
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05-28 362
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WSI 病理图像预处理（python）安装spams (失败)
h_sq__的博客
01-28 2127
安装spams 使用python对WSI（病理图像）进行预处理的时候，使用颜色标准化工具需要spams 但是使用pip install 安装很可能会出现失败。pip install spams 失败；这时采用python setup.py install 又报错了 No module named ‘numpy.distutils._msvccompiler’ in numpy.distutils; trying from distutils 根据这篇博客：https://blog.csdn.net/qq_
WSI医学图像处理
weixin_48615706的博客
06-20 642
参考链接--其他方法--实验数据cut。
TCGA数据库中WSI图像的切割
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04-17 4955
病理学WSI组织学图像的分割
关于WSI的处理
weixin_41529093的博客
06-30 709
仅作为记录，大佬请跳过。 传送门 github传送门 传送门
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栗子的博客
01-03 8834
目录染色归一化Vahadane的染色归一化基于Vahadane方法改进的颜色归一化方法Patch提取方式随机从有组织区域提取 此整理仅为自己在课题进展上的总结和应用，并不全 染色归一化 Vahadane的染色归一化 方法： 光密度计算 无监督染色密度估计 颜色归一化 归一化像素强度计算 github: https://github.com/xindubawukong/Vahadane（非原作者...
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悟
02-21 1339
常用的python库
（染色归一化）病理图像（HE或者WSI）图像标准化方法小介绍
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qq_34616741的博客
09-04 2万+
虽说是CSDN，但因为处理的过程中要用到病理图片，所以这里简单的介绍一下病理图像的标准化。 首先介绍一下我们的病理图像。 病理图像就是我们高中时候用的玻片在扫描仪下拍摄的高分辨率图像。具体制作过程可以参见百度。https://wenku.baidu.com/view/60b5d0fe2af90242a995e58a.html 病理图像可以帮助医生对病人做出诊断。通过病理图像，我们可以看到肿瘤细胞的.....................
[病理图像质控]分割病理图像（whole slide images，WSI）中包含组织的区域，去掉空白区域
qq_34616741的博客
04-12 8791
偷空写个帖子。 在处理全病理切片（WSI）的时候，经常会碰到一个问题。就是整个WSI很大，其中有很多空白的地方，深度学习或者传统的图像处理都不需要处理的，如何把这些空白区域去掉。 用的最多的是传统的灰度图OSTU分割，简单的说就是： #img 是原始的RGB图像 gray = cv2.cvtColor(img, cv2.COLOR_BGR2GRAY) #添加高斯模糊是为了填补一些比较小的孔洞，而且使得边界更加平滑 blur = cv2.GaussianBlur(gray ,(20,20),0) ret3,t
WSI效果检验 演示文稿.pdf
01-03
总之，这个演示文稿可能涵盖WSI图像的预处理、模型训练、性能评估和结果可视化等多个环节，全面展示了机器学习在病理学中的应用。对于理解和改进WSI分析的精确性和效率，这样的分析和可视化工作是至关重要的。
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07-27
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快速免疫荧光WSI图像分类的选择性目标开关
1SOS：用于快速免疫荧光整片图像分类的选择性目标开关萨姆·马克苏德1，2赵昆1彼得·霍布森2安东尼·詹宁斯2布赖恩·C。Lovell11 The University of Queensland，St Lucia QLD 4072澳大利亚2Sullivan Nicolaides ...
翻译：10. 选用技术方面：目前国内已经形成了较为完善的WSI全视野数字切片处理的理论，能够在数据预处理阶段完成对WSI图像的特征提取并实现基于特种重要性评价的特征序列化映射。
06-14
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09-09 694
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