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RSS订阅原创 机器学习模型SHAP解释——R语言
此处，会有歧义，谈谈个人见解，此种解释并非因果关系，与Logistic回归的OR值有区别，此种解释不是因果解释，我们不能因为预测变量shap值贡献大，而认为这个变量是结局变量的危险因素。但是R的SHAP解释，目前应用的包是shapviz，这个包仅能对Xgboost、LightGBM以及H2O模型进行解释，其余的机器学习模型并不适用。这里图片的背景是灰色的，这里的函数均是基于ggplot2绘制的，因此我们可以通过添加theme主题函数，来修改图片的背景。以上就是R的Xgboost模型的SHAP解释。
2024-04-04 00:21:08
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原创 小庞统计-美化图片系列之lasso图的美化（第1集）
彩色lasso图，使整个图形更加的美观，此外十折交叉验证的图可以根据不同的方差标注不同的颜色，使整个图形更加的便于理解，更加的直观表达出模型结果所包含的信息。glmnet主要用于lasso模型的拟合，family参数主要用于定义所要拟合的模型，这次教学主要采用的是cox的生存分析，所以family=“cox”在SCI发表上，往往分数越高的SCI配图也越精美，但如何绘制美化图形呢？ggsci包主要用于图形的配色，其中Lancet，JAMA等著名期刊的配色。ggplot包，众所周知的绘图工具包。
2023-09-11 00:36:49
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原创 R.相关系数图的绘制
为了可视化两变量或者多个变量之间的相关关系，我们可以绘制相关图，再做相关图的基础上再介绍一种用来查看数据分布的skimr包此包在查看数据的结尾可以显示直方图，可以更加简洁的看到数据的分布> skim(data)-- Data Summary ------------------------ ValuesName data Number of rows 418
2021-12-06 17:29:22
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新版TCGA数据整理，通过R语言实现TCGA数据整理
2024-04-05
空空如也
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