表型基本知识点

1、高通量表型(HTP):高效、可靠的表型分析方法,用于评估大量基因型,用于图像的数据采集

2、PHEOPSIS:自动红绿蓝成像和称重

3、PHEOPSIS-DB:存储数百GB的图像和元数据,用于提供数据和图像分析模块

4、GROWSCREEN:量化在改变的光照条件下幼苗生长适应的动态(总叶面积、相对生长率和根面积,该系统允许同时对拟南芥和烟草的叶片生长和叶绿素荧光进行表型分析,处理量约为每小时60株

5、QTL分析:用于定位控制数量性状的基因在基因组中位置的方法

6、Phenoscope:

7、带通滤波器:让特定的波通过

8、光系统Ⅱ:类囊体膜中的一种光合作用单位

9、FV/Fm:PSII最大光化学量子产量

10、TraitMill:专门用于禾谷类作物高产基因的发掘

11、HTPheno:imageJ插件之一,用于确定植物生长状况和适应性

12、GWAS:全基因组关联分析,全基因范围内SNP位点和对照组比较,找出变异等位基因

13、i-traits:难人工评估的基于图像的性状

14、DR性状:数字化的x射线成像

15、PhenoBox:开放硬件和开源表型分析系统,用于提取枝条性状

16、RGB成像(可见光):成本高,测量植物或器官形态特征、生物量,但无法提供生理信息

17、荧光:反应生理信号

18、热成像:获取植物或叶片的温度

19、高光谱:成本昂贵,可提供丰富频谱和空间信息,可用于评估疾病严重程度、水分状况和其他生理特征

20、CropDesign、Scanalyzer3D、HRPF都是基于植物到传感器

21、Phenofyn:测量叶片伸长率...到传感器

22、Rhizoslides:纸质根系生长和观察系统

23、Rhizoslider:纸质根系生长和观察系统   Rhizoponics:评估拟南芥RSA的水培根系观察器

24、PhenoBox 被广泛应用于研究模型草的感染、盐胁迫以及使用其他传感器(如高光谱成像传感器)观察其他作物。

25、(植物到传感器或传感器到植物)取决于提取的性状、测量物种的体积大小、温室容量和其他因素。

26、CropDesign、Scanalyzer3D 和 HRPF 都是基于植物到传感器模式,将植物转移到成像站以提取生物量、枝条生长和植物结构。

27、RSA:原位根系结构

28、X射线CT是一种三维结构成像应用,可以根据不同材料(如根系和土壤)的X射线衰减差异来可视化内部三维体积。

29、 RooTrak :用于利用土壤和根系之间的 X 射线衰减差异,重建三维根系

30、CT 倾向于提供来自小盆(例如直径为 34 毫米的盆)的更多细节,因为可以进行更高分辨率的扫描

31、NMRooting:图像分析软件

32、PET:检测正电子发射放射性核素的功能性成像

33、CT:倾向于提供小盆的更多细节,可进行高分辨率扫描

34、CT和MRI有高空间分辨率,但PET有高r放射性可在根系土壤间提供高对比度,PET和MRI扫描时间比CT长

35、田间表型分类:地面、无人机、手持型

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