一、样品分类 Q型分类-->>>核心
1.样品间的相似度量--距离 怎么计算?
两点之间的距离大于等于0 相反也相等 两点的距离小于求助某一点的距离 类似中介
2.具体方法
二、变量分类 R类--->>看变量的亲疏关系 实际 降维
变量之间相似度量--相似系数
第一种 夹角余弦
类间距离 最短距离 两类样品中之间的距离作为两类间的距离 最长距离 两类样品中之间的距离作为两类间的距离
三、方法步骤
例子
代码:
b =[7.9000 39.7700 8.4900 12.9400 19.2700 11.0500 2.0400 13.2900
7.6800 50.3700 11.3500 13.3000 19.2500 14.5900 2.7500 14.8700
9.4200 27.9300 8.2000 8.1400 16.1700 9.4200 1.5500 9.7600
9.1600 27.9800 9.0100 9.3200 15.9900 9.1000 1.8200 11.3500
10.0600 28.6400 10.5200 10.0500 16.1800 8.3900 1.9600 10.8100];
d1=pdist(b);%两个样本之间的距离
D=tril(squareform(d1))%转化为下三角
z1=linkage(d1,'complete');
z2=linkage(d1,'average');
z3=linkage(d1,'centroid');
z4=linkage(d1,'ward');
T=cluster(z1,4)%z1是两点之间的距离 4代表分成几个类 谁和谁在一个类