Linux平台运行任务的一些注意点

1.用CMake生成makefile，会轻松很多，我目前还是单个文件夹下编写项目所有文件的水平，还很low，下面是我的CMakeList.txt放在源代码目录下即可。

1 PROJECT(VF2.exe)
2 set(CMAKE_CXX_COMPILER "/usr/sw-cluster/intel/composer_xe_2013_sp1.3.174/bin/intel64/icc")
3 set(CMAKE_C_COMPILER "/usr/sw-cluster/intel/composer_xe_2013_sp1.3.174/bin/intel64/icc")
4 set(CMAKE_CXX_FLAGS "-std=c++11 -O3 ${CMAKE_CXX_FLAGS}")
5 CMAKE_MINIMUM_REQUIRED(VERSION 2.6)
6 AUX_SOURCE_DIRECTORY(. DIR_SRCS)
7 ADD_EXECUTABLE(VF2 ${DIR_SRCS})

第二三行指定编译器，第四行添加编译选项，第五行规定版本，第六行把当前文件夹下所有文件名赋值给变量DIR_SRCS，第七行是生成可执行文件。

2.使用bqueue提交任务。

bsub -q 队列名 -n 核数目 -o ./文件名 ./可执行文件名 即可。注意所有命令行选项都要出现在可执行文件名之前，这样任务完成以后就会把输出重定向到指定的文件。

另外bsub -q 队列名 -n 核数目 -I ./可执行文件名 > ./文件名&  是不行的，因为Linux的后台任务会自动关闭，重定向会提前关闭，等任务完成了，新的输出也写不进去。至于这个重定向什么时候关闭，为什么可交互程序没有运行完它就关掉，还需要研究。

以后正常写命令就行。

bjobs -a可以查看任务状态

3.使用torque

脚本文件job.sh和可执行文件最好放在同一个文件夹，可执行文件进行文件读取时，如果使用相对路径，可能不从可执行文件的目录开始相对，而是从脚本文件目录，也就是提交job.sh的目录。