RedHat 5.9安装R语言 R-2.13.0



整个安装过程真的好让人无语，我是纯手动安装！！

下载R-2.13.0源代码：http://cran.stat.ucla.edu/src/base/R-2/ 
 1、解压文件：tar –zvxf R-2.13.0.tar.tar
 2、进入R源文件目录：cd R-2.13.0
 3、执行  ./configure --prefix/usr/rna/R   （--prefix是关键，R是自建文件夹； /usr/rna是提前创建好的文件夹）

报错：

R需要Fortran编译器，而我们的环境中没有任何可用的Fortran编译器。

（1）官网下载：ftp://gcc.gnu.org/pub/gcc/releases

（2）这里使用的是gcc-4.7.2.tar.bz2

进入gcc路径后使用./configure -prefix/usr/local/gcc-4.7.2/

     一般会出现错误：

configure: error: Building GCC requires GMP 4.2+, MPFR 2.3.1+ and MPC 0.8.0+.
 Try the --with-gmp, --with-mpfr and/or --with-mpc options to specify
 their locations.  Source code for these libraries can be found at
 their respective hosting sites as well as at
 ftp://gcc.gnu.org/pub/gcc/infrastructure/.

     说明 gcc 需要以来 GMP 4.2+, MPFR 2.3.1+ and MPC0.8.0+

     因为直接使用GUN GCC官方的源码来安装需要编译源码，编译又要使用GCC，这样就进入死循环，所有需要先安装RMP包。

gcc需要GMP、MPFR、MPC三个库，由于MPFR依赖GMP，而MPC依赖GMP和MPFR，所以要先安装GMP，其次MPFR，最后才是MPC。 

（3）gcc官方下载相应包：ftp://gcc.gnu.org/pub/gcc/infrastructure/

     先安装GMP，其次MPFR，最后才是MPC

      安装GMP

 tar jxvf gmp-4.3.2.tar.bz2
    mkdir /usr/local/gmp-4.3.2
    ./configure --prefix=/usr/local/gmp-4.3.2/
    make
    make install

     MPFR 安装：

tar jxvf mpfr-2.4.2.tar.bz2 
mkdir /usr/local/mpfr-2.4.2
./configure --prefix=/usr/local/mpfr-2.4.2/ --with-gmp=/usr/local/gmp-4.3.2/     ##这里需要加入gmp库路径
make
make install

 MPC安装：

 

tar zxvf mpc-0.8.1.tar.gz
mkdir /usr/local/mpc-0.8.1
./configure --prefix=/usr/local/mpc-0.8.1/ --with-gmp=/usr/local/gmp-4.3.2/ --with-mpfr=/usr/local/mpfr-2.4.2/
 make
 make install

（ 4 ）   接下来进入 gcc 目录：

./configure --prefix=/usr/local/gcc-6/ -enable-threads=posix -disable-checking --disable-multilib -enable-languages=c,c++,java --with-gmp=/usr/local/gmp-4.3.2/  --with-mpfr=/usr/local/mpfr-2.4.2/ --with-mpc=/usr/local/mpc-0.8.1/ 

make后出现错误：

configure: error: cannot compute suffix of object files: 
cannot compile 

解决办法：添加环境变量

export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/usr/local/mpc-0.8.1/lib:/usr/local/gmp-4.3.2/lib:/usr/local/mpfr-2.4.2/lib

然后再执行 make ，的确你可以去做其他事情了，这个需要时间比较长。

（5）获取你会碰到错误gcc/lto-compress.c:28:18:fatal error: zlib.h: No such file or direct，那你得安装rpm -ivh zlib-devel-1.2.3-27.el6.i686.rpm

（6）现在可以make了  然后make install，如果不出意外，安装就能成功

 4、回到安装R的过程，执行make
 5、make install
 6、配置环境变量（在自己的工作目录下, 比如：/root），命令如下：

vi.bash_profile  打开文件后，在PATH=后再加 :/usr/rna/R/bin

 7、重新登入，然后就可以用了。（或者执行： source .bash_profile就不用重新登入了）

8、./configure--with-readline=no