![](https://img-blog.csdnimg.cn/20201014180756930.png?x-oss-process=image/resize,m_fixed,h_64,w_64)
随笔
samhuairen
这个作者很懒,什么都没留下…
展开
-
QTL定位原理学习
一直在学习QTL,数量遗传学,看了很多书,文献,但自己一直是模模糊糊,总觉得只知道其一,不知道其二,今天看王健康老师写的基因定位与育种设计,让我又有了一种从头学习一边的冲动,我大体看了我认为比较重要的两章,写了一个自学的提纲,希望能够填充满这个内容。提纲如下:欢迎有共同爱好者填写其中的内容。标记和图谱构建如何构建图谱 构建图谱用什么方法 如何用R实现F2群体单标记的t检验什么是t检验 什么是t分别 什么是正态分布 如何计算加性和显性效应,如何检测 说‘人话’的例子 R语言代码实现..原创 2020-11-26 16:52:39 · 3560 阅读 · 3 评论 -
人生在这里开始
一直以来想把自己的东西整理一下, 也一直的没有勇气写一个博客。渐渐的我觉得自己人生有些模糊。 写个博客就是想要把自己学到的或是自己看到的记载下来,然后慢慢的消化。我是一个半路“出家”的人, 以前把太多的时间放到了田间, 后来渐渐的自己喜欢上生物信息这个行业了,觉得有很多的东西要钻。 所以就慢慢的倒腾了很多有关生物信息的东西。 这个专业嘛, 就是一个大杂烩。 怎么说呢, 就是把利用我们所学的生物原创 2014-08-17 17:38:34 · 454 阅读 · 0 评论 -
phased 基因型或者unphased 基因型的理解
SNP芯片标记测到的是一对同源染色体上的两个碱基,比如,一个SNP标记在一个个体当中的的结果是AA,在另一个个体当中的结果是TT, 若两个SNP标记在同一条染色体上后,如果这个两个位点都是杂合的,一个是AT,另一个是AG,这个时候就有两种可能,要么AA是在同一个同源染色单体上(AA是一种单倍型,haplotype),要么AG(单倍型)是在同一个同源染色单体上,如果我们知道这个信息,那么这个基因型就翻译 2017-04-19 18:53:28 · 5164 阅读 · 0 评论 -
利用群体遗传数据估计基因组上重组率
计算所用软件:FastEPRR准备工作: 1. 准备输入文件,phased genotype file with VCF format 2. 如何实现 phased genotype file? 假如我们手中的是unphased的 vcf 文件或者hapmap 或者plink 软件格式。 首先准备VCF 格式,可以采用Mega2软件或者TASSEL 进行转化,我的文件是plink 的格原创 2017-04-21 21:24:11 · 10214 阅读 · 3 评论