blue-crab

Commands and Options

COMMANDS

p2s:

将 POD5 文件转换为 SLOW5/BLOW5 格式。

s2p:

将 SLOW5/BLOW5 文件转换为 POD5 格式。

p2s

blue-crab p2s [OPTIONS] pod5_dir1 -d output_dir
blue-crab p2s [OPTIONS] pod5_dir1 pod5_dir2 ... -d output_dir
blue-crab p2s [OPTIONS] file1.pod5 file2.pod5 ... -d output_dir
blue-crab p2s [OPTIONS] file.pod5 -o output.blow5
blue-crab p2s [OPTIONS] file.pod5 -o output.slow5

将 POD5 文件转换为 SLOW5/BLOW5 格式。
输入可以是单个 POD5 文件、多个 POD5 文件列表、包含多个 POD5 文件的目录或多个目录列表。如果提供了目录，该工具将递归搜索目录中的 POD5 文件（.pod5 扩展名）并将其转换为 SLOW5/BLOW5。
对于输入目录中的每个 POD5 文件，将在输出目录（用 -d 指定）中创建具有相同文件名的 SLOW5/BLOW5 文件。
注意：在转换具有多个运行 ID（也称为采集 ID）的 POD5 文件之前，请使用 ONT 的 pod5 工具将文件分成多个组。

-d, --out-dir STR: