m1A-prediction

m1A-prediction

从牛津纳米孔直接RNA测序数据中定量分析N1-甲基腺苷（m1A）RNA甲基化

默认模型仅适用于ONT测序数据

Ⅰ. 模型下载和依赖安装

(1). 模型下载

用户可以直接使用以下命令下载模型：

wget https://github.com/BernieeeX/m1a-prediction/tree/main/models

(2). 依赖安装

ont_fast5_api 是一个用于处理牛津纳米孔技术（ONT）Fast5文件的Python API。

源代码：https://github.com/nanoporetech/ont_fast5_api

可以从源代码构建：

git clone https://github.com/nanoporetech/ont_fast5_api
pip install ./ont_fast5_api

pyguppyclient 是一个用于与牛津纳米孔技术（ONT）的Guppy服务器通信的Python客户端库。ONT的Guppy服务器是一个用于分析基因测序数据的服务器端软件，能够接收原始电信号数据并将其转换为DNA序列。

源代码：https://github.com/nanoporetech/pyguppyclient

pip install pyguppyclient

依赖列表：

源代码依赖