Open Babel教程中文版——文件转换

文件转化

1. 桌面上建立一个Work文件夹
2. 从Protein Data Bank 中下载胰岛素（4ins）的PDB文件，并将其保存在“Work”文件夹中
   3.将文件输入格式设置为PDB，将文件名设置未下载的PDB文件

4. 将工作文件夹中输出文件格式设置为MOL，并将输出文件名设置为file:4ins.mol。

5. 点击CONVERT即可完成转换
   **

无文件格式的转换

**除了使用输入和输出文件外，还可以将化学文件格式的内容粘贴到输入框中，并在输出框中查看转换结果
以SMILES格式为例（以及SMILES格式如何处理立体化学结构）

1. 输入文件格式选择SMILES
2. 勾选以下输入框（忽略输入文件）
   
3. 将以下SMILES字符串（和分子标题）复制并粘贴到输入框中：

I/C=C/F I and F are trans
I/C=C\F I and F are cis
I[C@](Br)(Cl)F Anticlockwise from Iodine
I[C@@](Br)(Cl)F Clockwise from Iodine

4. 输出文件格式选择SMILES
5. 勾选以下选择框，再点击CONVERT
   
   在最终的描绘中，请注意，Open Babel仅为手性中心设置了一个立体键。 这并不是模棱两可的-这意味着立体键位于平面的上方或下方，其余三个键位于平面的相对位置。