阅读nnUNet V2代码——数据预处理—DefaultPreprocessor类

阅读nnUNet\nnunetv2\preprocessing\preprocessors\default_preprocessor.py文件

文件内有一个DefaultPreprocessor类和example_test_case_preprocessing函数（测试用的，跳过），阅读DefaultPreprocessor类。

在DefaultPreprocessor类内涉及的其他函数都在文章后半部分说明。

数据预处理是在生成dataset_fingerprint.json文件和生成nnUNetPlans.json文件后根据这两个文件内的信息操作的。

__init__函数

定义verbose，该变量用于确定是否打印更多信息的

run函数

参数

• dataset_name_or_id：数据集名称或id

• configuration_name：配置的名称，例如2d

• plans_identifier：默认nnUNetPlans

• num_processes：进程数

过程

逻辑和生成dataset_fingerprint.json文件差不多。

配置一些文件名称、路径，加载（读取）nnUNetPlans.json文件，实例化PlansManager类，读取配置信息（get_configuration函数）等。

最后是多进程处理数据，逻辑和