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原创 p-value&FPR以及q-value&FDR

在测序数据中,我们经常能在差异统计表格看到P-value以及FDR值。而在生信数据的分析中,也会经常对P-value进行FDR校正。这么做的目的是什么,FDR校正的原理又是什么呢?首先我们来看P-value的定义:在假设检验中,当原假设(H0)为真时,所得到的样本观察结果或更极端结果出现的概率。如果P-value很小,说明原假设为真时,这个数据甚至更极端的数据出现的概率很小;而当P-val

2018-01-07 00:12:53 28052

原创 illumina SBS测序详解

最近回头重新看了illlumina paired end sequence的测序原理视频,发现了以前没有注意的一些问题,而这些问题也是大家平时容易搞错的,因此花了几天时间将illumina 的paired end sequence 从构建文库到上机测序的整个过程以及原理较为详细的写了出来。基础知识:illumina测序的核心在于利用可逆终止的、荧光标记的dNTP进行边合成边测序   

2018-01-02 09:33:56 39816 10

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