零成本建立医学数据库之实践

先前写了篇网文《零成本建立中小型医学数据库》，将自己对建立医学数据库的一些思考和大家分享，然而内容思考多于实践，最近有机会将自己的一些想法付诸于实践， 为普外科建立一个甲状腺癌的小型的数据库，实践过程中，验证了之前文章中的一些想法，也对之前的一些想法进行了妥协， 也对建立医学数据库有一些新的了解。

一、之前文章中思考了三个方面

数据库采用MySQL作为载体

这与之前的想法是一致的， 这次用的是windows系统， 之前考察的是xampp这个软件包，但是其控制台在退出的时候总是报错，感觉稍有缺陷，进而转到wamp上，两者在形式上差不多， 目前来看后者用起来更加顺畅，更加适合windows系统。
建一台Linux的服务器然后用xammp或许才是最便捷的解决办法。

形式上，借鉴CDISC和MIMIC

CDISC和MIMIC都是关系型数据库的规范。CDISC是为进行随机对照临床试验提交数据建立的一套标准，从变量名到收集数据的内容都有明确的规定， 原来想以CDISC的规定来确定手头医学数据库的内容和形式，但是显然这套标准对于一般应用来说过于复杂，特别是英文缩写的变量名非常难以理解和记忆，所以基本上放弃了， 但是CDISC的一些核心理念还是对建立自己的数据库有很多的借鉴；而MIMIC是著名的公开的医学数据库，与我们的任务更加相似，可以说是一个典范，对我们数据库的建立有很多的借鉴，特别是通过对MIMIC数据库的学习， 对数据库后续的数据查询和使用过程有预先的了解，也对数据库的设计有了很多的启示。

内容上，专家意见和文献查询为主

在搜集哪些变量这个问题上，专家意见和文献查询是肯定要参考的方面，原来还设想了要参考结局指标核心数据集（COS），但是目前的甲状腺癌领域还没有COS进行参考，只好先放弃了参考COS。

二、实践中新的问题

如何便利数据录入?

1.将数据库建立在一台服务器上，直接在phmydamin客户端录入数据， 所有的数据在服务器终端上进行录入。
2.在1的基础上，对MySQL数据库设置局域网的访问，可以在手机或平板以及电脑多台终端进行数据录入：采用的是WAMP服务器， 局域网访问的话需要设置3个方面（大家结合网上已经有的教程看）：1. 修改Apache的config两个文件（如图），2.alias关于phpmyadmin的一个文件（如图）；3.电脑添加8080（我的是8080）和3306端口（这里给个站内的链接供大家参考https://blog.csdn.net/qq_43453731/article/details/96869664）。到这里其它的都可以先不用设置， 手机或这电脑在同一个局域网内的话都可以输入服务器电脑的IP地址（有的说一定要固态IP，我也没去验证）通过phpmyadmin进行访问mysql数据库。3.在excel终端录入数据，导入mySql服务器。
4.可不可以与Epidata数据录入软件相结合来录入医院的数据？熟悉Epidata的同事基本否定了这个想法，Epidata录入的形式适合流行病学调查表，首先要有一个调查表格，但是构建一个调查表格似乎也可以在考虑范围之内。
5.其它录入方式。中间有同事建议从医院信息科导出数据， 有待体验一下才能理解。

三、临床数据存在不准确的情形

最准确的是病历本上的数据，电子病历中的数据可能存在误差。
发生的环节：目前都是电子病历，医生撰写电子病历的时候存在复制/黏贴的情况，这个环节可能回出现问题。
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