预测模型研发管理
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探索预测模型落地事宜
预测模型的开发与应用研究
预测模型的开发、应用和动态化
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分享一个预测模型web APP的功能模块和界面的设计
随着医疗技术的不断进步,web APP是临床预测模型在医学领域的应用的重要形式。这里分享一个web APP的设计,手里有医学预测模型的可以尝试将其构建成webAPP,进而在临床实践中体验预测模型带来的便利。原创 2024-04-14 18:05:52 · 355 阅读 · 0 评论 -
医学论文写作中团队协作的软件支撑(论一个产品需求)
医学论文写作是一个团队的活动(虽然有时候是由一个人来完成的),需要多人来完成,这期间进行一定的协作是必不可少的,有助于降低写作的劳动的强度,提高写作的速度和质量。团队协作最难的环节在于组建一个合适的团队,可谓可遇而不可求,这里也不涉及团队组建的事情,只是对于建立了团队之后,介绍一些软件的来支撑团队的协作,而且这里的协作也仅仅限于医学论文写作过程中的协作。原创 2023-08-17 09:48:10 · 81 阅读 · 0 评论 -
部署深度学习APP的经历(docker,streamlit cloud,nuitka)
最近,接到一个部署深度学习APP的需求,这个APP使用torch、monai和pydicom等库构建了一个识别CT图像中皮下脂肪、内脏脂肪和骨骼肌,输入是CT图像,输出是识别的图像和相关数据。接手的时候,核心的算法已经制作完成,仅是需要我构建GUI并将其部署到某种途径上,实现其应用。原创 2023-07-03 08:50:02 · 843 阅读 · 0 评论 -
一个可以临床应用的临床预测模型具备的5个条件
1. 明确模型的适用条件虽然模型的构建目的相同,但是模型往往是根据不同的患者特征所构建的。比如,人种不同,一个以白种人为主要人群构建的模可能不适合于中国人;一个以老年人为主要人群构建的模型往往不适合于青年人。所以,使用模型之前要明确模型的适用条件,一般可以从发表文章的“入选和排除标准”中获得这方面的相关信息。在预测模型APP的构建中,也要对这方面的信息进行重点的描述,防止用户的误用。2. 模型本身参数达标模型具有恰当选择的预测变量,准确的精确度和符合要求的样本量。3. 经过外部验证根据国外的或者外原创 2021-07-12 16:13:43 · 1695 阅读 · 0 评论 -
临床预测模型研究需要明确的数个问题
临床预测模型研究需要明确的数个问题阅读了一些临床预测模型的论文,有一些个人的体会,和大家分享,有新的想法随时增加。1.采用什么样的策略筛选预测变量?临床预测模型的研究是建立在临床流行病学的基础上的研究。临床流行病学为疾病的结局筛选出了种种的危险因素,而临床预测模型则可以将这些危险因素综合在一个算法中,来实现其判断和预测的功能。这些经过临床流行病学筛选鉴定的危险因素,这里称之为“经证实的预测因素集”。与之相对的是,模型作者根据自己本地的数据用Lasso回归或者单因素检验等方法筛选出有统计学意义的预测变原创 2021-06-23 11:39:44 · 2677 阅读 · 0 评论 -
在没有原始数据的情况下, 我把列线图转换成了网页计算器
1.即将没落的列线图和已经兴起的预测计算器列线图是目前临床预测模型主要的展现形式之一,也被认为是预测模型在临床应用的重要形式之一,然而随着预测计算器的兴起,列线图的功能将逐渐被预测计算器所取代,原因有二:一、列线图的使用不够简便。首先,列线图的使用过程要先对照列线图最上端的标尺获得每个预测变量的得分,然后将各个得分相加而获得总分,最后以总分对照概率标尺获得患者患病的风险或者个概率。这个查找过程显然是需要一定的时间,如果预测变量少,时间还可以接受,如果增加预测变量的个数,得出结果的时间显然会超出可接受的范围原创 2021-07-05 14:49:42 · 2648 阅读 · 9 评论 -
kivy部署移动端预测模型网页计算器记录
kivy部署移动端预测模型记录之所以选择kivy作为移动端的语言,本人是首先了解的python,然后才来学习kivy,是看中了python的数据处理能力和施行机器学习算法的能力,kivy与python无缝结合,或许是优于其他类似的语言。架构(kv部分,python部分,APP部分如何组织)目前采用的一个架构是:from kv.lang.builder import Builder#第一部分: kv部分,其中构建了一个尖括号包裹的Widget, 尖括号包裹的widget在kv中被认为是'"root"原创 2021-05-27 13:35:15 · 386 阅读 · 0 评论 -
改善临床预测模型效能的额外方法
医学预测模型的数据特点是,数据量较小,多在1000以内;数据有标签属于“有监督学习”范畴;结局变量通常为分类数据,比如,疾病的结局是否发生,所以模型多属于分类模型;数据结构相对简单,以一维数据为主(少数模型处理二维的图片数据)。如何根据医学预测模型的特点来提升模型的预测效能,是关系到医学预测模型是否可以临床应用的关键。特别指出的是,模型的预测效能体现在两个方面,一方面是指模型在内部测试集中的效能,反映了构成模型的基本元素是否合适,比如预测因素个数和质量,模型所用的算法是否充份拟合数据等;另一方面是指模...原创 2021-11-19 13:06:53 · 1521 阅读 · 0 评论 -
时间序列库sktime 输入和模型构建介绍
sktime是一个新的处理时间序列的库,值得考察。原创 2022-04-01 13:54:15 · 4104 阅读 · 0 评论 -
用python做Cox分析的三个库的介绍和体验
跟时间相关的数据分析(预测模型),一个是时间序列(X随时间变化),另外一个就是Cox(y随时间变化),都有专门的包,statsmodel、lifelines和scikit-survival 是python中做Cox分析常见的三个文库,各有特点,所以充分了解和应用这三个库是有助于做好Cox分析。注意 请选择本人发布的镜像:survival-imbalance-auto-sklearn以运行该项目。statsmodels: 从统计学的角度来展示各种cox类数据相关的参数lifelines:更加丰富的单因素和回归原创 2022-06-02 14:49:33 · 5261 阅读 · 2 评论 -
带搜索和跳转功能Listview的flutter临床预测计算器APP
搜索功能的功用之所以带搜索功能的出发点是,1.如果APP数量较多,为了快速地找到需要的APP, 是不是可以疾病预测计算器的名称进行搜索 ;2.如果APP使用者具有某种危险因素,可能涉及多种疾病预测计算器,是不是可以对疾病危险因素进行检索而更全面了解自身的疾病发展的趋势。搜索功能策略设立一个Jason对象,然后通过list.where()对Jason对象进行搜索形成搜索的内容,然后展示搜索的内容。值得一提的三点(期间参考了许多的资料的三个内容),多个搜索条件:flutter 的list.w原创 2021-08-25 10:07:40 · 240 阅读 · 0 评论 -
尝试将临床预测模型部署到移动端
现在临床预测模型APP主要存在与网站上,需要联网进行访问,缺点是没有网路的情况下无法使用,和可能有一定的延迟,所以作为补充的一种形式是把临床预测模型布置到手机或者平板本地。本着这个想法投入到“如何将临床预测模型布置到移动端?”这方面的学习,起初以为业内可能已经有成熟的方法,...原创 2021-08-17 16:18:05 · 346 阅读 · 0 评论 -
临床预测模型网页计算器汇总-肿瘤篇
胃癌(转移)早期死亡:PMID: 32742500适用人群 :根据美国SEER数据库构建,不适合中国人群使用,仅用于学术讨论。List item原创 2021-07-13 10:14:39 · 875 阅读 · 0 评论 -
Python代码反向解析列线图nomogram自动计算各项得分及总得分
本篇文章所做的事情就是说在获得了裂线图以及必要的参数以后,反向地解释绘制的原理来并实线列线图各项得分的自动化。第一各项名词解释,第二,代码展示以及相应的解释第3种的函数构成一个函数,并进行嗯应用的演示。...原创 2021-04-15 15:10:00 · 5445 阅读 · 11 评论