R语言 ROC曲线截断值、特异性、敏感性和曲线下面积AUC值的计算和显示

最新推荐文章于 2024-03-14 22:35:15 发布

skywindy1

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分类专栏： ROC曲线文章标签： ROC曲线医学临床应用

本文链接：https://blog.csdn.net/skywindy1/article/details/102733318

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本文利用R语言的pROC包，计算并展示了体脂率对诊断妊娠期糖尿病的ROC曲线，探讨其在临床医学中的应用。通过分析得出，当体脂率截断值为13.500kg时，敏感性达到79.3%，特异性为40.2%，曲线下面积AUC最大值为0.61，表明体脂率可用于妊娠期糖尿病的风险筛查。

摘要由CSDN通过智能技术生成

R语言 ROC曲线截断值、特异性、敏感性和曲线下面积AUC值的计算和显示

R语言绘制ROC曲线在临床医学中的应用

#计算体脂率对诊断妊娠期糖尿病的ROC曲线、截断值
sumExcel1.2018合4_列合并症<- read.csv(“C:\Users\Desktop\sumExcel1_2019071.csv”,sep = “,”,header = TRUE)#读取数据，excel中数据格式如下图，数据有空值，符合实际应用情况

在这里插入图片描述
attach(sumExcel1.2018合4_列合并症)
print(sumExcel1.2018合4_列合并症)
#options(scipen = 1000)#样本超过一千才使用科学计数法
#var2 <- sumExcel1.2018合4_列合并症[c(‘体脂百分百_percent’,诊断妊娠期糖尿病0正常1 患病’)]
var2 <- subset(sumExcel1.2018合4_列合并症,
!is.na(sumExcel1.2018合4_列合并症[‘体脂百分百_percent’])&
!is.na(sumExcel1.2018合4_列合并症[‘诊断妊娠期糖尿病0正常1患病’]),
select=c(‘体脂百分百_percent’,诊断妊娠期糖尿病0正常1患病’))
#install.packages(“pROC”)#此程辑包要求R版本更新至3.5.1以上，仅第一次使用需要安装
library(pROC)#载入pROC包
modelroc <- roc(var2