DNA序列（Java语言）

题目描述：

一个DNA序列由A/C/G/T四个字母的排列组合组成。G和C的比例（定义为GC-Ratio)是序列中G和C两个字母的总的出现次数除以总的字母数目（也就是序列长度）。在基因工程中，这个比例非常重要。因为高的GC-Ratio可能是基因的起始点。给定一个很长的DNA序列，以及要求的最小子序列长度，研究人员经常会需要在其中找出GC-Ratio最高的子序列。

输入描述：

输入一个string型基因序列，和int型子串的长度。

输出描述：

找出GC比例最高的子串，如果有多个，输出第一个的子串。

示例：

输入：

AACTGTGCACGACCTGA

5

输出：

GCACG

解题思路：

先获取到字符串基因序列str和子串的长度len，其实GC比例最高就是找出现GC的字符串最多的子串。因此从下标为0的位置开始遍历，同时统计出现C或者G的个数，用max记录结果子串的起始下标，一旦count[i]超过count[max]，就将i赋值给max。最后输出str.substring(max,max+len)。

import java.util.*;
public class Main{
       public static void main(String[] args){
        Scanner sc=new Scanner(System.in);
        String str=sc.next();
        int len=sc.nextInt();
        int sz=str.length();//字符串总长度
        int[] count=new int[sz-len];
        int max=0;
        for(int i=0;i<sz-len;i++){
            String substr=str.substring(i,i+len);
            for(int j=0;j<len;j++){
                if(substr.charAt(j)=='C'||substr.charAt(j)=='G'){
                    count[i]++;
                }
            }
            if(count[max]<count[i]){
                max=i;
            }
        }
        String res=str.substring(max,max+len);
        System.out.println(res);
    }
}