R语言——在linux环境下如何画图或保存图片

最新推荐文章于 2024-04-12 09:50:18 发布
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分类专栏： R linux 文章标签： R linux 图片
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/snowdroptulip/article/details/78662112
版权
在Linux环境中，使用R语言进行图形操作时，由于默认缺少图形设备，直接运行plot等命令会遇到错误。解决方法是安装Cairo图形渲染库。通过R安装Cairo包，并使用Cairo来画图和保存图片。例如，输入特定命令可以创建并查看不同图片格式的支持情况。
摘要由CSDN通过智能技术生成

通常在win环境下，我们利用RStudio画图非常方便，直接plot就可以展现出图片，但是在linux环境下，我们通过shell则无法画图。


问题

例如我们在linux下的R中输入如下命令：

png('test.png')

则会出现如下错误信息：

Error in .External2(C_X11, paste("png::", filename, sep = ""), g$width,  :
  unable to start device PNG
In addition: Warning message：
In png("test.png") : no png support in this version of R

 

 

 此时提示png不被支持，我们输入如下命令： 

 

capabilities()
 

 屏幕出现如下提示： 

 

 

 

 

    jpeg      png     tiff    tcltk      X11     aqua http/ftp  sockets
   FALSE    FALSE    FALSE    FALSE    FALSE    FALSE     TRUE    

                

        

        

    




        

            

                    
                      最低0.47元/天 解锁文章
                        
                    
            

        

    

      

        

            

              
                
                  snowdroptulip
                
              
            

            

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                专栏目录
          










                



	

		

			

				
					
linux r语言作图,最简单最实用的R语言热图绘制教程（没有R基础-掌握只需10min）...

				
			

			

				

					weixin_34169503的博客
				

				

					05-14
					
					761
					
				

			

		

		

			
				
前面用Excel绘制热图，在熟练的情况下，操作起来其实还是比较快速和方便的，尤其对于具有代码恐惧症的朋友。教程发出去之后，即有收到消息，希望能写一个用R语言绘制热图的教程。考虑到目前本人的时间和精力以及”生信札记”公众号其实关注的人不多，我即应下，Excel绘制热图的推文阅读量超过500，我就写一个用R语言绘制热图的。然后….确实超过500了，那么也不爽约，动手写写。？如何写一个实用的，简单的用R...

			
		

	



                

              
                



	

		

			

				
					
操作系统实验一熟悉实验环境——Linux

				
			

			

				

					03-19
				

			

		

		

			
				
了解linux操作系统的启动过程和桌面环境；掌握VirtualBox虚拟机的使用 2.了解Linux的命令格式，掌握Linux中的操作命令；学会使用各种Shell命令操作Linux；学会如何得到帮助信息 3.熟悉Linux文件系统的文件和目录结构...

			
		

	



                


  
              

                


	

		

			

				
					
R语言如何单独保存输出图片文件

					
热门推荐

				
			

			

				

					dltan
				

				

					02-23
					
					6万+
					
				

			

		

		

			
				
前言：记得设置图片的保存工作路径，即数据文件路径：setwd(“C:\Users\TDL\Desktop\test.picture”)
1.图片文件保存输出
jpeg(file = "style.jpg")
plot(iris[,1],col="red")  ## 画图程序
dev.off();

2.图片尺寸调整输出
p.picture=paste(a,"test.jpg")
jpeg(p.pi...

			
		

	





	

		

			

				
					
R语言入门：R的基本绘图功能(柱状图、散点图、折线图、直方图和饼图)及其参数设置汇总

					
最新发布

				
			

			

				

					泥木的博客
				

				

					04-12
					
					3114
					
				

			

		

		

			
				
包括了R中的基础图形绘制，及其参数解释，参数包括：main、col、breaks、bg、pch等等。

			
		

	



		

			
		



	

		

			

				
					
linux上使用R保存图片

				
			

			

				

					qq_39306047的博客
				

				

					07-09
					
					1831
					
				

			

		

		

			
				
dir="/data/zhangyong/yyp/yypold/hic/chenhebing/cs" ##定义工作的文件夹


sedwd=(dir)
options(scipen = 20)
Args <- commandArgs(T)

library(GENOVA)


Ha40 <- load_contacts(signal_path = '/data/zhangyong/yyp/yypold/hic/chenhebing/cs/hic_results/matrix/GSE125129_

			
		

	





	

		

			

				
					
在linux终端保存matplotlib绘制的图像

				
			

			

				

					qq_29007291的博客
				

				

					04-21
					
					645
					
				

			

		

		

			
				
import matplotlib
matplotlib.use('Agg')
import matplotlib.pyplot as plt

fig, ax = plt.subplots()
bar_1 = ax.bar(x , np.array(finall_info[0]),  width=width, label=str(0), color='r')
bar_2 = ax.bar(x + width, np.array(finall_info[1]),  width=width, label=st

			
		

	





	

		

			

				
					
linux命令系列11：管道和重定向

				
			

			

				

					煜铭2011
				

				

					08-30
					
					597
					
				

			

		

		

			
				
0x00 Linux基础
学习基本的linux命令操作，对于我们熟悉linux或者unix系统还是很有帮助的

0x01 管道
批处理命令连接执行，使用 |
串联: 使用分号 ;
前面成功，则执行后面一条，否则，不执行:&&
前面失败，则后一条执行: ||

ls /proc && echo suss! || echo failed.
#能够提示命名是否执行成功or失败；

			
		

	





	

		

			

				
					
Linux云服务器上python画图并保存

				
			

			

				

					大黄的博客
				

				

					09-09
					
					1762
					
				

			

		

		

			
				
Ubuntu服务器调用python的matlabPlot画图报错
原因是服务器上没有GUI界面。
此时需要在头文件中加入前两行。
import matplotlib as mpl
mpl.use('Agg')
import matplotlib.pyplot as plt

然后把绘制好的文件，保存到某个目录下。
plt.savefig("test.pdf") 

需要注意的是，图片可以保存为jpg,png,pdf,eps多种格式等等，然后导出到本地即可查看。

...

			
		

	





	

		

			

				
					
R语言——聚类分析.ppt

				
			

			

				

					01-28
				

			

		

		

			
				
关于聚类分析的讲解及其r代码

			
		

	





	

		

			

				
					
在Windows上学习Linux——Linux桌面环境定制篇.pdf

				
			

			

				

					09-07
				

			

		

		

			
				
在Windows上学习Linux——Linux桌面环境定制篇.pdf

			
		

	





	

		

			

				
					
R语言——简单的抽样方法梳理

				
			

			

				

					03-04
				

			

		

		

			
				
Metropolis Hastings， Laplace Approximation， Gibbs，Bayesian liner regression，Bayesian logistic regression的原理简单介绍和算法，水平有限一定会有错，发这就是为了保存一下我辉煌的过去，我还这么认真学习...

			
		

	





	

		

			

				
					
标记语言——图片替换

				
			

			

				

					09-28
				

			

		

		

			
				
想浏览CSS教程请点这里。上文：标记语言——为文字指定CSS样式。Chapter 14 图片替换随着更多设计师与开发者开始使用标准(特别是CSS),每天都会有许多新技术被发现,达成相同目标的新方法,更好的方法也不断发展

			
		

	





	

		

			

				
					
R语言作图技巧—— 导出高清图

				
			

			

				

					生信了
				

				

					12-08
					
					5万+
					
				

			

		

		

			
				
原创:黄小仙
上一次小仙同学分享了 facet violin plot的画法，最后还卖了个关子，给大家留了个悬念。科研文章的插图通常要求比较高，不仅要精准地展示出数据，选对图表类型，还需要简洁优美（

			
		

	





	

		

			

				
					
【R语言】  用Rstudio 绘制基本图形（实验三）

				
			

			

				

					ly_6699的博客
				

				

					05-09
					
					1万+
					
				

			

		

		

			
				
本节目标
绘制条形图、直方图、箱线图、点图、饼图、核密度图和散点图
本节内容
1、将文件ClassResults.txt导入R中，文件内容如下图所示，并将文件内容存在数据框ClassResultsDatafram中。

解答
> CLassResultsDatafram<-read.table(file="C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\Class...

			
		

	





	

		

			

				
					
Linux下的图片路径

				
			

			

				

					汉诺塔少年的博客
				

				

					07-02
					
					3209
					
				

			

		

		

			
				
最近尝试了做点php小项目，使用到图片的地方突然发现显示不出来。

上网查了一下发现Linux本地图片填写绝对路径去定位似乎有问题，而填写相对路径的话则可以显示正确。

这个相对路径就是：

以你的html或者php文件所在目录为根目录。

比如说我的php文件在/var/www/html/yii/views/index.php,在这个php文件里面调用了一张图片；

而这张图片的存放在/var/...

			
		

	





	

		

			

				
					
R中解决png不能画图的问题

				
			

			

				

					a521286819的博客
				

				

					03-11
					
					3384
					
				

			

		

		

			
				
在生信分析中，常常在服务器上安装了R之后，在运行R画图脚本的时候会出现这样的报错：  
       unable to start device PNG
       Calls: png
       In addition: Warning message:
       In png("abc") : unable to open connection to...

			
		

	





	

		

			

				
					
【R语言】解决Rstudio中无法启动png装置的问题

				
			

			

				

					weixin_62511472的博客
				

				

					04-11
					
					5034
					
				

			

		

		

			
				
我找到的根目录是"C:\Users\ovo\AppData\Local\RStudio"然后再重新打服务器，在R中输入png()，没有出现报错，问题解决，可以正常运行了！最后保存好文件，关了Rstudio，重新打开，发现好了，且能在控制面板出图了。百度了很多方法都不行，最后终于找到一个真的有用的，步骤如下。误打误撞输入了dev.off()，结果发现又error了。5555卑微的发现R不从控制面板出图，直接保存了。然后又输入dev.new()，好像还是不行。如果png显示为TRUE的话，

			
		

	





	

		

			

				
					
linux如何保存图片结果

				
			

			

				

					ML_amateur的博客
				

				

					03-14
					
					1378
					
				

			

		

		

			
				
例：
plt.scatter(X, Y)
plt.savefig('./1.jpg')
plt.show()




			
		

	





	

		

			

				
					
R语言画图时常见问题

				
			

			

				

					程志伟的博客
				

				

					03-16
					
					3万+
					
				

			

		

		

			
				
各位朋友，我已开通微信公共号：小程在线

我会把文章及时的更新到公共号上，欢迎大家的关注。



1 如何在同一画面画出多张图？

修改绘图参数，如 par(mfrow = c(2,2)) 或 par(mfcol = c(2,2))；

par()：mar设置图离四个边缘的距离；bg设置背景颜色；xaxt和yaxt设置坐标轴标签的类型（=”n”表示不画轴标签）；xlim和ylim设置坐标轴的范围...

			
		

	





	

		

			

				
					
r语言 四格画图_R语言作图——Split violin plot

				
			

			

				

					05-14
				

			

		

		

			
				
Split violin plot 是一种用于比较两组数据分布的图形。在 R 语言中，可以使用 ggplot2 包中的 geom_violin() 函数来绘制 split violin plot。

下面是一个示例代码：

```R
library(ggplot2)

# 生成示例数据
set.seed(123)
data <- data.frame(group = rep(c("A", "B"), each = 100),
                   value = c(rnorm(100), rnorm(100, mean = 2)))

# 绘制 split violin plot
ggplot(data, aes(x = group, y = value, fill = group)) +
  geom_violin(trim = FALSE) +
  geom_boxplot(width = 0.1, fill = "white") +
  theme_bw() +
  labs(x = "Group", y = "Value") +
  scale_fill_manual(values = c("#00BFC4", "#F8766D"))
```

这段代码会生成一个包含 split violin plot 和 box plot 的图形，其中 x 轴为分组变量，y 轴为数值变量，fill 为分组变量的颜色，box plot 用于显示中位数和四分位数，并且将 split violin plot 的两个部分分别用不同的颜色填充。可以根据需要调整颜色和其他绘图参数。

			
		

	



              



  
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          需支付：10.00元
        

        
        
      

    

  





  

    
    
  

  

    
    
  








  

    

      

        

          

            
            
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