pvacseq 报错:ValueError: invalid literal for int() with base 10: '774-775'

Traceback (most recent call last):
  File "/usr/local/bin/pvacseq", line 11, in <module>
    sys.exit(main())
  File "/usr/local/lib/python3.5/dist-packages/pvacseq/pvacseq.py", line 84, in main
    args[0].func.main(args[1])
  File "/usr/local/lib/python3.5/dist-packages/pvacseq/lib/main.py", line 285, in main
    pipeline.execute()
  File "/usr/local/lib/python3.5/dist-packages/pvacseq/lib/pipeline.py", line 255, in execute
    self.generate_fasta(chunks)
  File "/usr/local/lib/python3.5/dist-packages/pvacseq/lib/pipeline.py", line 331, in generate_fasta
    lib.generate_fasta.main(generate_fasta_params)
  File "/usr/local/lib/python3.5/dist-packages/pvacseq/lib/generate_fasta.py", line 103, in main
    position = int(line['protein_position']) - 1
ValueError: invalid literal for int() with base 10: '774-775'

粗暴解决:
在vcf 文件中找到 蛋白位置774-775 的这一行(grep ‘774-775’ my.vcf

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