使用超级计算机提交任务的时候,经常会遇到类似如下报错:
error while loading shared libraries: libXXX.so:
cannot open shared object file: No such file or directory
这说明运行程序的时候,找不到libXXX.so这个动态库。
为什么找不到
通常原因是程序在登陆节点编译,在计算节点运行。但登陆节点和计算节点的环境不完全相同。
当用到的是一个只有在登陆节点有的动态库的时候,就会在计算节点运行时报错找不到库。
怎么办呢
简而言是,将这个登陆节点的库,拷贝到用户账户的某个目录下,并设置环境变量,让计算节点能够找到它就行了。
举一个例子
报错:
error while loading shared libraries: libgfortran.so.3:
cannot open shared object file: No such file or directory
寻找库
[user@ln%tianhe ~]$ locate libgfortran.so
/usr/lib64/libgfortran.so.3
备注:使用locate命令寻找系统默认路径下的库,而另一些库可能在系统的共享目录下,或者用户自己安装的某个目录下,故需要联系管理员,或联系安装这个库的人。
创建目录拷贝库
[user@ln%tianhe ~]$ mkdir $HOME/lib
[user@ln%tianhe ~]$ cp /usr/lib64/libgfortran.so.3 $HOME/lib
设置环境变量
[user@ln%tianhe ~]$ export LD_LIBRARY_PATH=$HOME/lib:$LD_LIBRARY_PATH
备注:可写入~/.bashrc文件,需要source ~/.bashrc后生效
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