如何在lammps里加入新的势函数形式?

最新推荐文章于 2024-07-26 15:06:20 发布
最新推荐文章于 2024-07-26 15:06:20 发布
阅读量7.2k 收藏 9
点赞数 2
文章标签： lammps 编译
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/sowhatgavin/article/details/81878217
版权

官方

参考官方手册，先看看：传送门。

自己编程

如果没有，就自己写吧。

可以先参考已经有的势函数，弄清楚框架和写法，再写自己的。有的时候不仅要写 .cpp 文件，还要写一个 .h 头文件。

编译

把写好的东东放在lammps/src目录，然后按照以前的方法make即可。

可以参考文章：lammps 编译安装教程（一）。

我的个人网站：传送门

MrZhengGang
关注
lammps教程：EAM势参数设置详解
lammps_jiayou的博客
02-23 6044
合金体系的势函数除了eam势，还有meam势。在新版本的lammps中，meam势类型已经改为meam/c，本文主要介绍meam/c势的设置方法。 和普通的势函数文件不同，meam/c势有两个势函数文件：library.meam和**.meam，**表示不同的势函数名称。 library.meam通用文件 library.meam类似于参数库，存储了多种元素的meam参数，每一种元素占3行，共19个通用参数。 例如，下面一段代码是ZrCu合金的library.meam文件： #elt lat z iel
lammpsin文件参数文件_lammps力场文件_lammps、in文件、势函数、参数_分子动力学_
10-01
标题和描述提到的“lammps.in”文件是LAMMPS模拟的主要输入文件，而“lammps力场文件”则包含了描述粒子间相互作用的势函数和参数。 首先，我们需要理解“lammps.in”文件。这是LAMMPS执行模拟时读取的指令集，包含...
lammps教程：EAM势函数设置详解
lammps_jiayou的博客
02-21 1万+
上期介绍了LJ势函数参数写法，本期主要介绍金属体系势函数的设置。 金属原子之间没有键连接，因此，在lammps模拟中，金属体系的势函数类型为pair_style，而不是bond_style。 模拟金属体系时，可以用LJ势描述金属原子之间的受力，不过更精确的是嵌入原子势（EAM），eam势函数公式为： eam势由两部分组成，在原子对势（pair）的基础上添加了电子云密度相关项，比单纯的对势精确度更高。 eam势函数写在一个以“.eam”为后缀的文件中，lammps自带的势函数包含一部分eam势文件，也可以到
lammps模拟——NiTi纳米压痕模拟出现黏附现象
最新发布
wq1352014的博客
07-26 632
金刚石压头则一般认为是刚体，所以在C-C间一般不施加无势函数，在本次模拟中也尝试了SiC的tersoff势和FeC的EAM势，但暂未发现C-C间势函数对模拟结果有明显影响，所以后文中模拟均未在C-C势中施加势函数。使用Morse势做纳米压痕发现基体和压头会出现黏附现象。常用的有Morse势和lj势。
分享几个查找势函数的网站以及查找晶格常数的网站/软件
nmrwxw的博客
01-07 3277
为大家分享几个查找势函数的网站以及查找晶格常数的网站/软件查找势函数的网站使用 LAMMPS、GULP 等分子动力学方法模拟时经常会用到力场参数，如 Buckingham、Born-Mayer、Morse、eam、SW 等，这些参数可从已发表的文献中查到，但是查找起来相对麻烦，可能需要查阅很多篇论文才能找到需要的参数。分享几个常用的查找势函数的几个网站。
[分子动力学模拟资料]几种常用力场参数网站及LJ参数计算
m0_60787307的博客
04-10 1万+
原创一直陪着你的LAMMPS交流站 我们在使用分子动力学模拟时，常常需要力场参数或势函数文件，本文就推荐几个常用的EAM势＼MEAM势及LJ势的力场参数网站，欢迎大家补充。 力场参数常用网站 EAM势及MEAM势: 1.lammps官网: https://www.lammps.org/ lammps官网的GitHub是时常更新的,比我们安装目录下的势文件要多,在这里可能会找到我们需要的势文件 2.Interatomic Potentials Reposit...
lammps教程：官方自带eam_database程序拟合EAM势方法介绍
lammps_jiayou的博客
05-16 3226
使用lammps模拟金属体系，最常用的势函数为eam、meam势。 对于大多数金属或者合金来说，可以从网上下载相对应的eam或meam势力场文件。 而对于一些新的合金材料，可能就找不到相对应的力场文件。 解决的方法有两种，一是采用混合势（pair_style hybrid），第二种方法是自己拟合势函数文件。 混合势的写法在前面文章中已经介绍过，本文介绍一种拟合EAM势的方法。 该方法是运行Xiaowang Zhou编写的一个拟合程序，该程序可自动生成所需要的合金势。 这个程序能够拟合的合金元素有： Cu,
在lammps模拟过程中的常用势函数设置
热门推荐
qq_44963682的博客
09-25 3万+
在lammps模拟中，势函数的使用必不可少。如何选择合适的势函数？如何设置势函数？这对初学者来说较为困难，本文介绍在lammps模拟中常用的势函数如何使用，希望能够帮助初学者加深对势函数的了解。
lammps模拟技巧：高熵合金势函数设置三种方法
lammps_jiayou的博客
10-06 7446
大家好，我是小马老师。 本文继续介绍lammps模拟中的势函数设置方法。 在前面的文章中，介绍过高熵合金的建模：高熵合金建模 高熵合金包含的原子数较多，势函数的设置相对复杂，在平时一对一的咨询中，这种问题也相对较多。 下面介绍三种高熵合金势函数设置方法。 1.下载专用势函数 下面的网站包含了大多数原子的势函数： https://www.ctcms.nist.gov/potentials/ 如需下载包含Fe原子的势函数，直接点Fe： 出现势函数列表： 比如Al-Co-Cr-Fe-Ni就是高熵合金AlCoC
lammps中进行纳米压痕模拟的势函数
12-05
lammps中进行纳米压痕模拟的势函数
铝的势函数
05-18
lammps 势函数 reax，描述了铝原子与其他原子的相互作用
lammps 2022最新版源文件
07-20
例如，可以添加新的势能函数、新的算法或者集成外部代码。 3. **灵活输入语法**：LAMMPS的输入文件是文本格式，易于编写和理解，支持多步模拟序列和复杂的条件判断，可以方便地进行参数调整和脚本编程。 4. **丰富...
Lammps在拉伸过程中的应用,lammps实例教程,Fortran
09-10
**Lammps在拉伸过程中的应用** LAMMPs（Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator）是一款强大的分子动力学模拟软件，广泛应用于物理、化学、材料科学以及生物科学等领域。它支持多种计算方法，...
lammps：pcff势函数参数设置方法
lammps_jiayou的博客
09-13 4257
大家好，我是小马老师。 本文介绍lammps模拟中pcff势设置方法。 cvff、pcff是ms文件转换为lammps data文件最常用的两种势。 相比于cvff势，pcff势参数更多，但在设置方式上和cvff势过程是一样的。 本文以沥青材料为例，介绍pcff势设置方法。 (1) 建模并转换为data文件 在ms中使用AC模块建立沥青模型，使用forcite模块设置pcff力场，导出为asphalt.car。 使用msi2lmp转换为data文件： msi2lmp asphalt -class II -f
实验电镜距离测量之Matlab处理
Rockyoung
06-29 575
在拍摄电竞的时候，我们通常会对图片进行处理，比如，测量距离等等。那么如何根据现有图片结果，快速测量呢？
【Lammps】Zhou势函数拟合（python程序）
haoweixl的博客
02-05 1112
早期的Zhou势用Fortran编写，在使用之前需要进行对源代码进行编译，操作较为麻烦，后期lammps提供了一个python版本的Zhou势拟合程序。下面是官方对Zhou势函数拟合的说明文档。Zhou合金势主要用于金属的分子动力学模拟 ，下面将主要对lammps自带程序生成相关合金势函数。文件夹中存在下述程序，其中 create_eam.py 就是我们需要的。拟合好的势函数在eam_database文件夹中，打开如下图所示。
Deepmd-lammps在集群上的编译方法（以南方科大的集群为例）
qq_42482909的博客
04-22 4863
Deepmd是一款高效的神经网络势函数训练软件，只需要有一些Linux和基本的lammps分子动力学基础的使用者即可上手。Deepmd具有很好的lammps接口。但是对于初学者而言，deepmd-lammps编译不是一件容易的事，编译过程中的坑非常非常多。即便deepmd官网上手册中有打包好conda包，但由于不同的编译环境，编译出来的结果有可能是报错的。除此之外，官网的一键安装包在编译过程中没有采用intel的加速功能，实际测试与本方法相比速度慢了大约1倍左右（原因是因为lammps官网有个加速的包...
lammps教程：OPLS势函数参数设置方法
lammps_jiayou的博客
08-10 4832
大家好，我是小马老师。 本文介绍OPLS势函数的设置方法。 lammps力场大体分为两种情况： 一种类似于eam这种势，参数是写到eam力场文件中的，在使用的时候需要下载力场文件，在设置时不需设置力场参数，只需映射原子类型即可。 另一种力场则不需要力场文件，如lj/cut。这种力场大多使用公式描述原子间相互作用力，这些公式内嵌在lammps代码中，在设置力场时，不需要下载力场文件，只需要设定公式中的参数即可。 本文所讲的OPLS属于第二种力场，不需要力场文件，但是需要设置力场参数。 OPLS对应的公式为：
lammps教程：推荐一个LJ力场参数查询及参数转换网站
lammps_jiayou的博客
05-10 7947
使用lammps模拟时经常会用到LJ力场参数，这些参数可从已发表的文献中查到，但是查找起来相对麻烦，可能需要查阅很多篇论文才能找到需要的参数。 推荐一个LJ参数查询网站： http://lammpstube.com/mdpotentials/ 直接点击元素名称即可查得该元素对应的LJ力场参数，点击Download可以下载对应的参考文献，如Fe的LJ参数为： 有些元素可能仅能查到某一单位下的参数，例如Si的LJ参数只有kcal/mol单位： 如果是在metal单位下进行Si的lammps模拟，需要把k
lammps混合势函数
09-14
在LAMMPS中，可以使用混合势函数来描述具有多种原子类型的复合材料系统。对于混合势函数的设置，有以下两种常见的方式： 1. EAM/LJ混合势：这种混合势函数可以同时使用EAM（Embedded Atom Method）势函数和LJ（Lennard-Jones）势函数来描述不同类型的原子相互作用。在LAMMPS中，可以使用`pair_style hybrid`命令来设置混合势函数，其中包括`pair_style eam/alloy`和`pair_style lj/cut`两个子势函数。通过使用`pair_coeff`命令为每种原子类型分配相应的势函数参数，即可定义该混合势函数。 2. MEAM/C混合势：除了EAM势函数，LAMMPS还支持使用MEAM/C（Modified Embedded Atom Method）势函数来描述合金体系。与EAM/LJ混合势类似，也可以使用`pair_style hybrid`命令来设置MEAM/C混合势函数，其中包括`pair_style meam`和`pair_style lj/cut`两个子势函数。同样，使用`pair_coeff`命令为每种原子类型分配相应的势函数参数，以定义该混合势函数。 需要注意的是，在使用混合势函数时，需要确保正确设置每种原子类型的势函数参数，并进行适当的交叉验证，以保证计算结果的准确性。同时，LAMMPS官方文档中也提供了详细的势函数设置方法和示例，可以参考相关文档进行更详细的了解和学习。
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值