生物信息资源更新越来越快,使用可视化的方法来分析DNA序列已成为生物信息学的一个研究热点,用图形表示DNA序列的方法也越来越成熟。2011年,著名杂志《Science》发表一篇引起轰动的文章:《Presenting the Human Genome:Now is 3D!》,这篇文章完全给我们描述了人类基因组测序未来的蓝图,可见3D技术在很多领域都是发展方向。 使用mono可以快速的创建DNA分子结构立体模型,效果如下: 当然简单的呈现DNA分子结构,仅仅是一部分功能,如果将mono和专业的DNA分析仪结合,不仅可以发现病症,更重要的是预测病症的发生,治病于未发,这将是人类的福音。除了研究人类基因之外,我们还可以对农作物的进行DNA3D模型化,并加以分析,对农业的发展和粮食安全方面都会有积极的意义。 使用mono创建3D模型最大的特点就是快,代码不过几十行,使用Editor更是不需要代码量。本文的效果图通过代码实现,核心代码如下:
1
function createDNA(box, x, y, z, colors){
2
var count=20+Math.random()*50;
3
var dist=50;
4
var parent=createNode(box, 10, 0,0,0,'red');
5
for(var i=0;i<count;i++){
6
var angle=Math.PI*2/360*15*i;
7
var radius = (i % 2==0) ? 10: 7;
8
var color = colors[i%2]
9
var node1=createPairNode(box, dist, radius, i, angle, color);
10
var node2=createPairNode(box, dist*0.3, radius, i, angle, color);
11
node1.setParent(parent);
12
node2.setParent(parent);
13
14
if(i % 2==0){
15
var link=createLink(box, node1, node2, dist, angle, 'gray');
16
var node3=createPairNode(box, dist*0.58, radius*0.4, i, angle,'cyan');
17
var node4=createPairNode(box, dist*0.72, radius*0.4, i, angle,'cyan');
18
link.setParent(parent);
19
node3.setParent(parent);
20
node4.setParent(parent);
21
}
22
}
23
parent.setPosition(x,y,z);
24
parent.setStyle('m.visible',false);
25
returnparent;
26
}
1
function createPairNode(box, size, radius, index, angle, color){
2
var x=size*Math.sin(angle);
3
var z=size*Math.cos(angle);
4
var y=index * 10;
5
var node = createNode(box, radius, x, y, z, color);