分开供电的硬盘可以正常使用吗？

在一个硬盘中装了一个linux系统(fedora21)，外置硬盘。
使用时，我使用外部电源给这个硬盘供电，但是就是读取不到boot.cfg文件，一直不知道原因。

后来猜测时因为硬盘使用外部供电，然后拆下主机硬盘后，安装上这个外置硬盘，就可以读取到了。

具体的原因不清楚，理论上不是设备供电了，驱动正常就可以使用了麻？
有了解的，希望可以留言，交流一下。
也是一个坑，也记录一下。