在R中安装TensorFlow、TensorFlow_Probability、numpy(R与Python系列第二篇)

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目录

前言：

0-在R中配置Python环境

 1-安装tensorflow库

Step1: 下载R包tensorflow

Step2：安装TensorFlow库

 Step3：导入R中

附加：安装过程中注意事项 

2-安装tensorflow_probability库

Step1：下载R包：tfprobability

Step2：安装TensorFlow Probability Python库

Step3 :将TensorFlow Probability Python库导入R中

附加：安装过程中可能会遇到的问题

3-安装numpy模块

使用py_install()函数安装numpy模块

4-reticulate::import()函数介绍

参考：

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前言：

本文主要介绍在R中安装Python模块：tensorflow、tensorflow_probability、NumPy。

值得注意的是，安装Python模块前，不要在R项目中安装和导入Python模块，否则会报错的。（tensorflow模块会报错，rensorflow_probability、NumPy模块不会报错），但总的来说，在安装和导入Python模块前，不要在R项目中进行。

0-在R中配置Python环境

安装上述Python模块，首先需要在R中搭配好Python环境。如何在RStudio中配置Python环境，请看将 Python 与 RStudio IDE 配合使用（R与Python系列第一篇）。这个推文给出了最简单的在R中配置Python环境的步骤，不需要单独下载Python软件，也不需要下载Anaconda平台，直接在RStudio中使用R命令下载miniconda，实现R中配置Python环境，值得注意的是，目前R函数tenorflow::install_tensorflow()只兼容miniconda python.

 1-安装tensorflow库

Step1: 下载R包tensorflow

install.packages("tensorflow")
library("tensorflow")

Step2：安装TensorFlow库

install_tensorflow()

 Step3：导入R中

>reticulate::import("tensorflow")
Module(tensorflow)

注：这一步相当于检查是否将Python的tensorflow库安装上了。 

附加：安装过程中注意事项 

安装TensorFlow模块的时候，不要提前创建R项目，如果创建R项目，会正常运行上述代码（Step1至Step2），不会出现任何错误，但是当导入tensorflow模块的时候，会得到下面的错误：

所以，在安装Python TensorFlow模块的过程中，一定不要在R项目中安装TensorFlow库。

参考：installation problem · Issue #3 · t-kalinowski/deep-learning-with-R-2nd-edition-code · GitHub

2-安装tensorflow_probability库

TensorFlow Probability是一个建立在TensorFlow之上的统计计算和概率建模库。它的构建块包括广泛的分布和可逆变换、可用于模型的概率层以及概率推理工具，包括变分推理和马尔科夫链蒙特卡洛。

tfprobability R包是与Python库“TensorFlow Probability”的接口。

Step1：下载R包：tfprobability

• 从CRAN安装已发布的版本tfprobability
  •  install.packages("tfprobability")
• 从GitHub上安装：
  • devtools::install_github("rstudio/tfprobability")

注：安装二选一即可，要么从CRAN上下载，要么从GitHub上下载。tfprobability：tf表示TensorFlow的简写，后面的probability表示概率。

Step2：安装TensorFlow Probability Python库

使用install_tfprobability()安装TensorFlow和TensorFlow Probability Python模块。

library(tfprobability)
install_tfprobability()

这样你就自动获得当前稳定版本的TensorFlow Probability和TensorFlow Python模块。

Step3 :将TensorFlow Probability Python库导入R中

（相当于检验TensorFlow probability Python模块是否安装好）

> reticulate::import("tensorflow_probability")
Module(tensorflow_probability)

或者运行如下代码不出错：

# create a binomial distribution with n = 7 and p = 0.3
d <- tfd_binomial(total_count = 7, probs = 0.3)

# compute mean
d %>% tfd_mean()
# compute variance
d %>% tfd_variance()
# compute probability
d %>% tfd_prob(2.3)

附加：安装过程中可能会遇到的问题

 解决方案：重启R，快捷键Ctrl+Shift+F10。重新运行相应语句就好了，不需要做其他额外操作。

参考：tfprobability namespace load failed · Issue #147 · rstudio/tfprobability · GitHub

No module named 'tensorflow_probability' · Issue #155 · rstudio/tfprobability · GitHub

3-安装numpy模块

使用py_install()函数安装numpy模块

reticulate::py_install("numpy")

Step2：使用import()函数导入R中

> reticulate::import("numpy")
Module(numpy)

4-reticulate::import()函数介绍

import中文意思是导入，在R帮助文件中描述import函数为：导入Python模块（import a Python module）.

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参考：

【R语言】TensorFlow安装及使用笔记 - 知乎 (zhihu.com) （介绍如何在RStudio中安装tensorflow Python模块）

TensorFlow for R - Quick start （官方提供的在R中安装tensorflow模块）

与 TensorFlow Probability 的接口 • tfprobability (rstudio.github.io)（安装tensorflow_probability模块指南）

TensorFlow for R (rstudio.com) （官方提供安装Tensorflow指南）

No module named 'tensorflow_probability' · Issue #155 · rstudio/tfprobability · GitHub

tfprobability namespace load failed · Issue #147 · rstudio/tfprobability · GitHub

Installing Python Packages • reticulate