碱基 A 和 C 方式排序

引言

在生物学中，很多时候我们需要对碱基序列进行排序，这里分别介绍 A（可重复排序） 排序和 C（不可重复排序） 排序。

正文

A 排序

根据排列组合公式可得总共的排序组合数为 $3\times 3\times 3=27$。

lst = ['A', 'C', 'G']
lst1 = []
for i in lst:
    for j in lst:
        for k in lst:
            str1 = "".join([i, j, k])
            print(str1)
            lst1.append(str1)

print(len(lst1))
print(lst1)
"""
result:
AAA
AAC
AAG
ACA
ACC
ACG
AGA
AGC
AGG
CAA
CAC
CAG
CCA
CCC
CCG
CGA
CGC
CGG
GAA
GAC
GAG
GCA
GCC
GCG
GGA
GGC
GGG
27
['AAA', 'AAC', 'AAG', 'ACA', 'ACC', 'ACG', 'AGA', 'AGC', 'AGG', 'CAA', 'CAC', 'CAG', 'CCA', 'CCC', 'CCG', 'CGA', 'CGC', 'CGG', 'GAA', 'GAC', 'GAG', 'GCA', 'GCC', 'GCG', 'GGA', 'GGC', 'GGG']
"""

C 排序

根据排列组合公式可得总共的排序组合数为 $3\times 2\times 1=6$。

lst = ['A', 'C', 'G']
lst1 = []
for i in lst:
    for j in lst:
        if j != i:
            for k in lst:
                if k != i and k != j:
                    str1 = "".join([i, j, k])
                    print(str1)
                    lst1.append(str1)

print(len(lst1))
print(lst1)
"""
result:
ACG
AGC
CAG
CGA
GAC
GCA
6
['ACG', 'AGC', 'CAG', 'CGA', 'GAC', 'GCA']
"""

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