将研究化合物之间的转化,即如何处理化学信息学中的化学反应。
首先,您将学习如何扩展单个化合物的表示法,例如先前处理的MOL文件和SMILES表示法,以表达化学反应。接下来,让学习如何在RDKit中处理化学反应。
RXN文件
使用MOL文件格式表示化学反应的扩展名为RXN file的格式。由于基本结构单元相同,因此可以处理MOL文件和SDF的软件通常可以处理RXN文件。
例如,考虑以下乙酸和甲胺之间的酰胺化反应。
如果您尝试使用“另存为”保存用ChemBioDraw绘制的文件,则可以选择“反应Molfile(RXN)”,如下所示。