CBCT三维重建

概述

CBCT旋转机架通过旋转扫描,获取序列X射线图像,经过三维重建算法生成三维图像。重建方式主要有两种:本地重建(加载序列图像和几何文件)、在线重建(在图像采集过程中同步进行三维重建)。根据不同体位,又区分为全扇扫描(200°)和半扇扫描(360°),本文仅描述CBCT图像三维重建操作流程。

基本流程

1、采集X射线序列图像,按全扇扫描200°,间隔0.5°,采集帧数400帧:
在这里插入图片描述
X射线图像:
在这里插入图片描述

2、生成几何标定xml文件,包含参数主要有以下:

    SourceToIsocenterDistances;

    SourceToDetectorDistances;

    GantryAngles;
   
    ProjectionOffsetsX;
  
    ProjectionOffsetsY;

    InPlaneAngles;

    OutOfPlaneAngles;
   
    SourceOffsetsX;

    SourceOffsetsY;

3、FDK三维重建算法(参考RTK)生成三维体素
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述在这里插入图片描述

上述三维模体采用CatPhan500,重建结果经过CT标准值线性变换和射野外数据消除处理。

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CBCT(锥形束CT)是一种医学影像学技术,它利用锥形束X射线扫描器和数字成像技术获取三维图像。在Python中,可以使用多种库进行CBCT三维重建,如PyQT、PyVista、SimpleITK等。 以下是使用SimpleITK库进行CBCT三维重建的示例代码: ```python import SimpleITK as sitk # 读取CBCT图像数据 filename = 'cbct.nii' image = sitk.ReadImage(filename) # 设置重建参数 pixel_spacing = [0.5, 0.5, 0.5] # 重建像素大小 origin = image.GetOrigin() # 重建起点 direction = image.GetDirection() # 重建方向 size = [512, 512, 512] # 重建图像大小 # 进行三维重建 reconstructor = sitk.FDKConeBeamReconstructionImageFilter() reconstructor.SetGeometry(sitk.ConeBeamReconstructionGeometry()) reconstructor.SetInput(image) reconstructor.SetOutputSpacing(pixel_spacing) reconstructor.SetOutputOrigin(origin) reconstructor.SetOutputDirection(direction) reconstructor.SetSize(size) output = reconstructor.Execute() # 保存重建结果 output_filename = 'cbct_reconstructed.nii' sitk.WriteImage(output, output_filename) ``` 在代码中,首先使用SimpleITK库读取CBCT图像数据。然后,设置重建参数,包括重建像素大小、重建起点、重建方向和重建图像大小。最后,使用FDKConeBeamReconstructionImageFilter进行三维重建,并将结果保存为NIfTI格式的文件。 需要注意的是,CBCT三维重建是一项复杂的任务,需要深入了解相关的医学影像学知识和重建算法。此处仅提供了一个简单的示例代码,仅供参考。

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