ubuntu14.04下ITK4.8，VTK6.2和Qt4整合笔记

比较好的ubantu14.04的博客，ITK/VTK的安装等

http://my.oschina.net/u/1046919/blog/483789

ubuntu14.04下ITK4.8，VTK6.2和Qt4整合笔记

整合这三个，对于刚接触的新手我来说是一件很复杂的玩意，根本无从下手，网络整合的资源也不多，而且大部分是用cmake来管理项目，直接用过Qt的.pro文件来管理项目还是很少的，因此通过这次整合经历，记录出现问题，以便翻阅。

一 整合

通过Qtcreator创建Qt项目，会出现带有.pro文件的项目。

编辑.pro文件

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QT       += core gui   greaterThan(QT_MAJOR_VERSION, 4): QT += widgets   TARGET = vtkQtTest TEMPLATE = app     SOURCES += main.cpp\          mainwindow.cpp   HEADERS  += mainwindow.h   FORMS    += mainwindow.ui     INCLUDEPATH += /usr/local/include/vtk-6.2 INCLUDEPATH += /usr/local/include/ITK-4.8   LIBS += -lvtkalglib-6.2\   -lvtkChartsCore-6.2\   -lvtkCommonColor-6.2\   -lvtkCommonComputationalGeometry-6.2\   -lvtkCommonCore-6.2\   -lvtkCommonDataModel-6.2\   -lvtkCommonExecutionModel-6.2\   -lvtkCommonMath-6.2\   -lvtkCommonMisc-6.2\   -lvtkCommonSystem-6.2\   -lvtkCommonTransforms-6.2\   -lvtkDICOMParser-6.2\   -lvtkDomainsChemistry-6.2\   -lvtkexoIIc-6.2\   -lvtkexpat-6.2\   -lvtkFiltersAMR-6.2\   -lvtkFiltersCore-6.2\   -lvtkFiltersExtraction-6.2\   -lvtkFiltersFlowPaths-6.2\   -lvtkFiltersGeneral-6.2\   -lvtkFiltersGeneric-6.2\   -lvtkFiltersGeometry-6.2\   -lvtkFiltersHybrid-6.2\   -lvtkFiltersHyperTree-6.2\   -lvtkFiltersImaging-6.2\   -lvtkFiltersModeling-6.2\   -lvtkFiltersParallel-6.2\   -lvtkFiltersParallelImaging-6.2\   -lvtkFiltersProgrammable-6.2\   -lvtkFiltersSelection-6.2\   -lvtkFiltersSMP-6.2\   -lvtkFiltersSources-6.2\   -lvtkFiltersStatistics-6.2\   -lvtkFiltersTexture-6.2\   -lvtkFiltersVerdict-6.2\   -lvtkfreetype-6.2\   -lvtkftgl-6.2\   -lvtkGeovisCore-6.2\   -lvtkgl2ps-6.2\   -lvtkGUISupportQt-6.2\   -lvtkGUISupportQtOpenGL-6.2\   -lvtkGUISupportQtSQL-6.2\   -lvtkGUISupportQtWebkit-6.2\   -lvtkhdf5-6.2\   -lvtkhdf5_hl-6.2\   -lvtkImagingColor-6.2\   -lvtkImagingCore-6.2\   -lvtkImagingFourier-6.2\   -lvtkImagingGeneral-6.2\   -lvtkImagingHybrid-6.2\   -lvtkImagingMath-6.2\   -lvtkImagingMorphological-6.2\   -lvtkImagingSources-6.2\   -lvtkImagingStatistics-6.2\   -lvtkImagingStencil-6.2\   -lvtkInfovisCore-6.2\   -lvtkInfovisLayout-6.2\   -lvtkInteractionImage-6.2\   -lvtkInteractionStyle-6.2\   -lvtkInteractionWidgets-6.2\   -lvtkIOAMR-6.2\   -lvtkIOCore-6.2\   -lvtkIOEnSight-6.2\   -lvtkIOExodus-6.2\   -lvtkIOExport-6.2\   -lvtkIOGeometry-6.2\   -lvtkIOImage-6.2\   -lvtkIOImport-6.2\   -lvtkIOInfovis-6.2\   -lvtkIOLegacy-6.2\   -lvtkIOLSDyna-6.2\   -lvtkIOMINC-6.2\   -lvtkIOMovie-6.2\   -lvtkIONetCDF-6.2\   -lvtkIOParallel-6.2\   -lvtkIOParallelXML-6.2\   -lvtkIOPLY-6.2\   -lvtkIOSQL-6.2\   -lvtkIOVideo-6.2\   -lvtkIOXML-6.2\   -lvtkIOXMLParser-6.2\   -lvtkjpeg-6.2\   -lvtkjsoncpp-6.2\   -lvtklibxml2-6.2\   -lvtkmetaio-6.2\   -lvtkNetCDF-6.2\   -lvtkNetCDF_cxx-6.2\   -lvtkoggtheora-6.2\   -lvtkParallelCore-6.2\   -lvtkpng-6.2\   -lvtkproj4-6.2\   -lvtkRenderingAnnotation-6.2\   -lvtkRenderingContext2D-6.2\   -lvtkRenderingContextOpenGL-6.2\   -lvtkRenderingCore-6.2\   -lvtkRenderingFreeType-6.2\   -lvtkRenderingFreeTypeOpenGL-6.2\   -lvtkRenderingGL2PS-6.2\   -lvtkRenderingImage-6.2\   -lvtkRenderingLabel-6.2\   -lvtkRenderingLIC-6.2\   -lvtkRenderingLOD-6.2\   -lvtkRenderingOpenGL-6.2\   -lvtkRenderingQt-6.2\   -lvtkRenderingVolume-6.2\   -lvtkRenderingVolumeOpenGL-6.2\   -lvtksqlite-6.2\   -lvtksys-6.2\   -lvtktiff-6.2\   -lvtkverdict-6.2\   -lvtkViewsContext2D-6.2\   -lvtkViewsCore-6.2\   -lvtkViewsInfovis-6.2\   -lvtkViewsQt-6.2\   -lvtkzlib-6.2\         LIBS+=-lITKBiasCorrection-4.8\   -lITKBioCell-4.8\   -lITKCommon-4.8\   -lITKDICOMParser-4.8\   -lITKEXPAT-4.8\   -lITKFEM-4.8\   -lITKgiftiio-4.8\   -lITKIOBioRad-4.8\   -lITKIOBMP-4.8\   -lITKIOCSV-4.8\   -lITKIOGDCM-4.8\   -lITKIOGE-4.8\   -lITKIOGIPL-4.8\   -lITKIOHDF5-4.8\   -lITKIOImageBase-4.8\   -lITKIOIPL-4.8\   -lITKIOJPEG-4.8\   -lITKIOLSM-4.8\   -lITKIOMesh-4.8\   -lITKIOMeta-4.8\   -lITKIOMRC-4.8\   -lITKIONIFTI-4.8\   -lITKIONRRD-4.8\   -lITKIOPNG-4.8\   -lITKIOSiemens-4.8\   -lITKIOSpatialObjects-4.8\   -lITKIOStimulate-4.8\   -lITKIOTIFF-4.8\   -lITKIOTransformBase-4.8\   -lITKIOTransformHDF5-4.8\   -lITKIOTransformInsightLegacy-4.8\   -lITKIOTransformMatlab-4.8\   -lITKIOVTK-4.8\   -lITKIOXML-4.8\   -lITKKLMRegionGrowing-4.8\   -lITKLabelMap-4.8\   -lITKMesh-4.8\   -lITKMetaIO-4.8\   -lITKniftiio-4.8\   -lITKNrrdIO-4.8\   -lITKOptimizers-4.8\   -lITKOptimizersv4-4.8\   -lITKPath-4.8\   -lITKPolynomials-4.8\   -lITKQuadEdgeMesh-4.8\   -lITKSpatialObjects-4.8\   -lITKStatistics-4.8\   -lITKVideoCore-4.8\   -lITKVideoIO-4.8\   -lITKVNLInstantiation-4.8\   -lITKVTK-4.8\   -lITKVtkGlue-4.8\   -lITKWatersheds-4.8\   -lITKznz-4.8\   -litksys-4.8\   -litkvnl-4.8 \   -litkvnl_algo-4.8

对于INCLUDE代码后面要加上自己的ITK和VTK的include文件夹，注意自己的在哪里，写正确位置，后面的LIBS一般在/usr/local/lib/目录下，注意把原来前面的lib换成-l，最前面要有空格，最后的.so要删除，连接用"\"符号。

test.cxx文件，代码如下：

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#include "itkImageFileReader.h" #include "itkImageToVTKImageFilter.h"   #define vtkRenderingCore_AUTOINIT 4(vtkInteractionStyle,vtkRenderingFreeType,vtkRenderingFreeTypeOpenGL,vtkRenderingOpenGL) #define vtkRenderingVolume_AUTOINIT 1(vtkRenderingVolumeOpenGL) //注意以上两句 cmake管理可以不用 #include <vtkSmartPointer.h> #include "vtkImageViewer2.h" #include "vtkRenderWindowInteractor.h" #include "vtkRenderer.h" #include "vtkRenderWindow.h" #include "vtkInteractorStyleImage.h" #include "itkJPEGImageIOFactory.h" #include "vtkImageMapper3D.h" #include "vtkImageActor.h"   //#include "vtkJPEGReader.h" #define JPEG_IMAGE_FILE_PATH "/home/jason/123.jpg" //#include "itkRescaleIntensityImageFilter.h"     using  namespace  itk;   int  main( int  argc,  char  *argv[]) {      typedef  itk::Image<itk::RGBPixel<unsigned  char >, 2> ImageType;      typedef  itk::ImageFileReader<ImageType>             ReaderType;      typedef  itk::ImageToVTKImageFilter<ImageType>       ConnectorType;      itk::JPEGImageIOFactory::RegisterOneFactory();     //注意这里的注册，用cmake管理可以不用      ReaderType::Pointer reader = ReaderType::New();      ConnectorType::Pointer connector = ConnectorType::New();        reader->SetFileName(JPEG_IMAGE_FILE_PATH);      connector->SetInput(reader->GetOutput());        vtkSmartPointer<vtkImageActor> actor =        vtkSmartPointer<vtkImageActor>::New(); //一定要注意下面的代码，不然可能是一片黑    # if  VTK_MAJOR_VERSION <= 5      actor->SetInput(connector->GetOutput());    # else      connector->Update();      actor->GetMapper()->SetInputData(connector->GetOutput());    #endif      vtkSmartPointer<vtkRenderer> renderer =        vtkSmartPointer<vtkRenderer>::New();      renderer->AddActor(actor);      renderer->ResetCamera();        vtkSmartPointer<vtkRenderWindow> renderWindow =        vtkSmartPointer<vtkRenderWindow>::New();      renderWindow->AddRenderer(renderer);        vtkSmartPointer<vtkRenderWindowInteractor> renderWindowInteractor =        vtkSmartPointer<vtkRenderWindowInteractor>::New();      vtkSmartPointer<vtkInteractorStyleImage> style =        vtkSmartPointer<vtkInteractorStyleImage>::New();        renderWindowInteractor->SetInteractorStyle(style);        renderWindowInteractor->SetRenderWindow(renderWindow);      renderWindowInteractor->Initialize();        renderWindowInteractor->Start();        return  EXIT_SUCCESS; }

如果使用cmake管理项目，只要在CMakeLists.txt写上

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cmake_minimum_required(VERSION 2.4) project(test) find_package(ITK REQUIRED) include(${ITK_USE_FILE})      if  (ITKVtkGlue_LOADED)          find_package(VTK REQUIRED)           include(${VTK_USE_FILE})      else ()          find_package(ItkVtkGlue REQUIRED)          include(${ItkVtkGlue_USE_FILE})          set(Glue ItkVtkGlue)      endif()  add_executable(test MACOSX_BUNDLE test.cxx) target_link_libraries(test  ${Glue}  ${VTK_LIBRARIES} ${ITK_LIBRARIES})

就可以了，记得改文件的名字，我的是test.cpp。

如果还有疑问可以上一下两个网站参考：

http://www.itk.org/Wiki/ITK/Examples

http://www.vtk.org/Wiki/VTK/Examples

二 错误

1.之前除了两个与vnl有关的错误，具体报错忘记了，可以在.pro中添加

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1 2	-litkvnl-4.8 \   -litkvnl_algo-4.8

之前的文件已经添加了可以在最后面找到。

2.用一般的cmake管理项目时，ITK读取文件可以直接用

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const  char  * ImageFileName =  "" ; const  unsigned  int  Dimension = 2;       typedef  unsigned  char  PixelType; typedef  itk::Image< PixelType, Dimension > ImageType;       typedef  itk::ImageFileReader< ImageType >  ReaderType; ReaderType::Pointer reader = ReaderType::New();   reader->SetFileName(ImageFileName ); try {      reader->Update();      return  EXIT_FAILURE; } catch ( itk::ImageFileReaderException & ) {      std::cout <<  "fail.\n"  << std::endl; }

直接用采用Qt项目，用ITK来读取图片的时候，直接这样写会报错误

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terminate called after throwing an instance of  'itk::ImageFileReaderException'    what():  /usr/local/include/ITK-4.8/itkImageFileReader.hxx:143:   Could not create IO object  for  reading file /home/jason/program/ITK-4/Examples/Data/BrainT1Slice.png    There are no registered IO factories.    Please visit http: //www.itk.org/Wiki/ITK/FAQ#NoFactoryException to diagnose the problem.

http://www.itk.org/Wiki/ITK/FAQ#NoFactoryException这里给出的解释是：

（1）如果是用cmake，需要在add_executable 或者 add_library之前添加

        include( ${ITK_USE_FILE} )

（2）如果没有使用cmake，必须对factories进行注册，可以使用

        XXXImageIOFactory::RegisterOneFactory(),XXX是类型

具体的代码：

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const  char  * metaImageFileName =  "" ;      const  char  * pngFileName =  "" ;            const  unsigned  int  Dimension = 2;            typedef  unsigned  char  PixelType;      typedef  itk::Image< PixelType, Dimension > ImageType;            typedef  itk::ImageFileReader< ImageType >  ReaderType;      ReaderType::Pointer reader = ReaderType::New();            typedef  std::list< itk::LightObject::Pointer > RegisteredObjectsContainerType;                  RegisteredObjectsContainerType registeredIOs =      itk::ObjectFactoryBase::CreateAllInstance(  "itkImageIOBase"  );      std::cout <<  "When CMake is not used to register the IO classes, there are\n"                  << registeredIOs.size()                  <<  " IO objects available to the ImageFileReader.\n"  << std::endl;                  std::cout <<  "When we try to read a MetaImage, we will " ;      reader->SetFileName( metaImageFileName );      try      {          reader->Update();          return  EXIT_FAILURE;      }      catch ( itk::ImageFileReaderException & )      {          std::cout <<  "fail.\n"  << std::endl;      }                  std::cout <<  "After registering the MetaImageIO object, " ;      itk::MetaImageIOFactory::RegisterOneFactory();            std::cout <<  "there are\n" ;      registeredIOs = itk::ObjectFactoryBase::CreateAllInstance(  "itkImageIOBase"  );      std::cout << registeredIOs.size()                  <<  " IO objects available to the ImageFileReader.\n"  << std::endl;            std::cout <<  "Now, when we try to read a MetaImage, we will " ;      try      {          reader->Update();          std::cout <<  "succeed.\n"  << std::endl;      }      catch ( itk::ImageFileReaderException & error )      {          std::cerr <<  "Error: "  << error << std::endl;          return  EXIT_FAILURE;      }                  std::cout <<  "Every format desired to be supported by the reader\n"                  <<  "must be registered."  << std::endl;      itk::PNGImageIOFactory::RegisterOneFactory();      reader->SetFileName( pngFileName );      try      {          reader->Update();      }      catch ( itk::ExceptionObject & error )      {          std::cerr <<  "Error: "  << error << std::endl;          return  EXIT_FAILURE;      }

参考代码：http://itk.org/ITKExamples/src/IO/ImageBase/RegisterIOFactories/Documentation.html

3.如果出现一下错误，找不到vtkImageSliceMapper，

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Starting /home/jason/QtProjects/build-vtkQtTest-unknown-Debug/vtkQtTest... Generic Warning: In /home/jason/program/VTK-6.2.0/Rendering/Core/vtkImageSliceMapper.cxx, line 35 Error: no override found  for  'vtkImageSliceMapper' .   Generic Warning: In /home/jason/program/VTK-6.2.0/Rendering/Core/vtkRenderWindow.cxx, line 40 Error: no override found  for  'vtkRenderWindow' .   Generic Warning: In /home/jason/program/VTK-6.2.0/Rendering/Core/vtkRenderer.cxx, line 46 Error: no override found  for  'vtkRenderer' .

需要在#include任何有关vtk的头文件之前添加

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1 2	#define vtkRenderingCore_AUTOINIT 4(vtkInteractionStyle,vtkRenderingFreeType,vtkRenderingFreeTypeOpenGL,vtkRenderingOpenGL) #define vtkRenderingVolume_AUTOINIT 1(vtkRenderingVolumeOpenGL)

这两句，具体为什么还没有搞懂，如果有人知道希望能告知。

也可以使用代码

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1 2	#include <vtkAutoInit.h>   VTK_MODULE_INIT(vtkRenderingOpenGL);

但是会出现其它警告

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Starting /home/jason/QtProjects/build-vtkQtTest-unknown-Debug/vtkQtTest... Warning: In /home/jason/program/VTK-6.2.0/Rendering/Core/vtkInteractorStyleSwitchBase.cxx, line 43 vtkInteractorStyleSwitchBase (0x1924210): Warning: Link to vtkInteractionStyle  for  default  style selection.

原因还未分析。

如果是使用cmake管理，那么就不会有这个错误，在CMakeLists.txt里都定义好了，不会有问题。