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王元启的生信记录
致力于质谱数据处理分析、图像数据前处理、深度学习算法优化、AI绘画领域及数据分析技术的推广和应用。一枚野生爱好家，欢迎大家的关注，感谢大家的喜欢，继续坚持写下去！！！
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GC-MS图谱数据前处理
上一篇博客的内容比较适合LC-MS数据前处理，基于GC-MS的图谱前处理也可以通用，但是效果不好，在接触了2016年开发的erah包，毅然决然的选择了这种方法进行GC-MS 数据的前处理。R版本依然是3.6以上同样的也是先将.raw文件转换为.mzXML文件安装包和载入，此包安装需要很多依赖包，它会自行安装install.packages("erah")library(erah)创建CSV文件在数据文件夹，具体的自行替换createdt("D:/XSHPCOS1/")ex <-原创 2020-07-30 17:26:26 · 4261 阅读 · 10 评论 -
组学数据图谱前处理
由于经常遇到坑，其他方法也有局限性，选择了这种方法的原始数据处理，里面的参数还需要根据实际图谱进行调整。基于R的XCMS包进行图谱原始数据额处理，版本3.6以上 安装XCMS包，最新的版本if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))install.packages("BiocManager")BiocManager::install("xcms")Library(XCMS)导入数据，原始数据是.RAW文件，需转换为mzXML原创 2020-07-29 18:00:35 · 2180 阅读 · 4 评论