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组装
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Still a long way to go.
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Linux系统下,计算并输出宏组装数据N50/N90值
Linux系统下,计算并输出宏组装数据N50/N90值——bioawk原创 2024-02-19 12:57:04 · 1003 阅读 · 1 评论 -
Reads, Metagenomic assembly, and custom MAGs的区别与联系解读
这三个数据类型之间存在层次关系。Reads 是从原始测序数据中获得的,而 Metagenomic Assembly 则是对 Reads 进行更深入的分析和组装得到的结果。Reads 提供了初步的、整体的微生物群落信息,Metagenomic Assembly 提供了更大、更完整的基因组片段,而 Custom MAGs 允许研究者更有针对性地研究特定微生物群体。Custom MAGs 的选择通常基于研究者对微生物群体的特殊关注,可以是生态学上的关注、功能学上的关注,或者是对特定物种的深入研究。原创 2024-01-22 14:48:37 · 678 阅读 · 0 评论 -
宏转录组组装软件rnaSPAdes输出文件解读
rnaSPAdes作为宏转录组数据组装软件,数据结果表现优秀——共输出5个文件夹及14个单独的文件,transcripts.fasta是主要结果文件。原创 2024-01-18 11:07:25 · 1211 阅读 · 1 评论