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Linux
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WDPLA
Still a long way to go.
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Linux中,批量重命名“.fna”文件为“.fa”文件——rename命令原创 2024-02-23 12:06:21 · 473 阅读 · 1 评论 -
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geNomad:识别移动遗传元素——输出文件解读:6个目录文件、6个log原创 2024-02-22 15:56:30 · 876 阅读 · 1 评论 -
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Linux系统下,计算并输出宏组装数据N50/N90值——bioawk原创 2024-02-19 12:57:04 · 1084 阅读 · 1 评论 -
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ViIBRANT,一款开源的从宏组装数据中识别病毒contig的软件原创 2024-01-26 09:51:17 · 1269 阅读 · 1 评论 -
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Linux系统下,病毒组分析模块化流程ViWrap的安装与环境配置全流程解读,含conda activate报错解决方法原创 2024-01-19 14:26:55 · 1359 阅读 · 4 评论 -
宏转录组组装软件rnaSPAdes输出文件解读
rnaSPAdes作为宏转录组数据组装软件,数据结果表现优秀——共输出5个文件夹及14个单独的文件,transcripts.fasta是主要结果文件。原创 2024-01-18 11:07:25 · 1265 阅读 · 1 评论 -
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宏数据组装软件mataSPAdes输出文件解读——共7个文件夹和16个单独文件,scaffolds.fasta是最终组装结果原创 2024-01-16 10:24:27 · 1618 阅读 · 1 评论 -
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linux系统中将.fastq文件统一改为.fq文件——使用rename和mv循环原创 2024-01-15 09:47:37 · 681 阅读 · 0 评论 -
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在生物信息学分析中常需要用到,将fasta格式的序列转为fastq,而后再压缩为fastq.gz格式上传。本篇记录如何将在linux系统中将fasta格式文件转为fastq.原创 2023-11-16 23:28:53 · 541 阅读 · 2 评论