matlab mafdr,matlab FDR校正

MATLAB中的mafdr函数用于FDR(False Discovery Rate)校正,尤其适用于大量ttest的情况。当p值数量小于1000时,Storey procedure可能会崩溃,此时推荐使用mafdr函数的'BHFDR'选项,以获得更稳健但更保守的结果。文章介绍了mafdr函数的使用场景和与其他校正方法的对比。

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http://home.52brain.com/forum.php?mod=viewthread&tid=27066&page=1#pid170857

http://www.mathworks.com/matlabcentral/answers/144113-mafdr-interpreting-q-values-vs-bhfdr-adjusted-p-values

matlab自带函数mafdr,当ttest数较多时,可直接用[FDR, Q]=mafdr(P);但是Storey procedure在p值少于1000个时会崩溃,此时应改用BH FDR方法:mafdr(P,'BHFDR', true)。该方法对于少量ttest更稳健,但是更保守。

学习笔记49—matlab FDR校正

matlab自带函数mafdr,当ttest数较多时,可直接用[FDR, Q]=mafdr(P):但是Storey procedure在p值少于1000个时会崩溃,此时应改用BH FDR方法:mafd ...

学习笔记50—多重假设检验与Bonferroni校正、FDR校正

总结起来就三句话: (1)当同一个数据集有n次(n>=2)假设检验时,要做多重假设检验校正 (2)对于Bonferroni校正,是将p-value的cutoff除以n做校正,这样差异基因筛选的p ...

SPM FDR校正

来源: http://blog.sciencenet.cn/blog-479412-572049.html,http://52brain.com/thread-15512-1-1.html SPM8允 ...

假设检验:p-value,FDR,q-value

来源:http://blog.sina.com.cn/s/blog_6b1c9ed5

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