Linux系统怎么安装pymol,Linux（CentOS 7）（64位）系統下安裝Pymol（1.8.6）

PyMOL簡介

PyMOL是一款生物大分子三維結構顯示軟件，其中“Py”是指此軟件使用Python語言編寫，“MOL”是指Molecule。

PyMOL官網是http://www.PyMOL.org/，發展歷史和軟件更新動態可在此查詢。

PyMOL的學習網站是http://www.PyMOLwiki.org/index.php/Main_Page，若想用好PyMOL，此網站是必上網站，其實這一個也就夠了。

硬件環境

CentOS 7(64位)系統中安裝Pymol1.8.6

安裝依賴包

yum install subversion gcc gcc-c++ kernel-devel python-devel tkinter python-pmw glew-devel freeglut-devel libpng-devel freetype-devel libxml2-devel

安裝過程遇到錯誤，發現是缺少下面的依賴

yum install msgpack-devel

獲取安裝包

cd /download

svn co svn://svn.code.sf.net/p/pymol/code/trunk/pymol

cd pymol

編譯安裝

建立一個腳本文件，把下面的代碼放進去，把腳本文件放入pymol文件夾，運行該腳本。

#!/bin/bash -e

prefix=/opt/pymol-svn

modules=$prefix/modules

# If you want to install as root, then split this line up in "build"

# and "install" and run the "install" with "sudo"

python2.7 setup.py build install \

--home=$prefix \

--install-lib=$modules \

--install-scripts=$prefix

進入  opt/pymol-svn/pymol文件夾

/opt/pymol-svn/pymol運行下面的命令，創建連接，命令端輸入pymol運行。

sudo ln -s /opt/pymol-svn/pymol /usr/bin/pymol

Pymol運行效果展示

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