Linux 系统虚拟环境中安装pymol【HTTP 000报错问题】

【前提：在虚拟环境中安装pymol】

命令：

conda insall -c shrodinger pymol -y

运行时出现以下报错：

 解决：

（1）网卡：

设置了时间延长：

（2）添加conda-forge :

conda config --append channels conda-forge

（3）换源：

考虑是否由源的问题所引起：

将所有源都删除【gedit ~/.condarc  或者 vim~/.condarc】

然后添加清华源

conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/msys2/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/pytorch/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes

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或者添加中科大源：

conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/msys2/
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/menpo/
conda config --set show_channel_urls yes

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默认源：

conda config --remove-key channels

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conda config --show
查看所有的源

（4）conda 版本需要更新，所以总报错：

更新conda:

第一步：查看conda的版本：

conda --info

conda --version

conda -V

第二步：

conda update conda

conda updata -n base conda 

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然后再进行：

conda insall -c shrodinger pymol 【去掉-y】

ps: -y

在安装包的时候会出现以下的命令，输入y或者n，表示是否继续安装，直接在安装命令中写入-y 可以忽略这个步骤，直接安装

The following NEW packages will be INSTALLED:

Proceed ([y]/n)? y
 

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进行了多次的修改，最终在更新conda 以及 去掉-y之后安装成功！！

第一次安了pymol的其他附包，显示conda安装进度为0，结束之后继续执行安装命令即可，直到安装完成！！！！：）