linux分析mirna,从高通量测序的数据中分析novel miRNA

做miRNA分析的人都知道，已有的miRNA注释并不完整，同时miRNA的表达有时间和空间的特异性，因此在进行miRNA的测序分析之后，大家往往会对其中的新的miRNA更感兴趣，在这里给大家介绍一款在植物当中，基于miRNA-seq数据的novelmiRNA的分析软件，miRDP。

RNA干扰现象最早在植物研究中有所报道，当在矮牵牛中转入可以增加花瓣红色色素的基因时，花瓣的颜色没有加深反而变成了白色。这一现象一直困扰了人们多年，直到AndrewFire和CraigMellode的线虫实验对此做出了解释，他们发现当向线虫中转入一系列编码肌肉基因的mRNA单链时，对线虫的运动并不会有任何影响，而将正反义链同时转入的时候，线虫表现出异常的运动形式，与这些基因敲除的表型一致。后经一系列的实验证明，当转入可以和目的基因互补的mRNA双链时，可以沉默目的基因，据此他们提出了RNA干扰学说。