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原创 读书笔记---植物基因组学(樊龙江主编)

读书笔记---植物基因组学(樊龙江主编)

2023-04-26 16:04:20 487 1

原创 读书笔记---晚熟的人(莫言)

第一次读莫言的书,这本书都是小故事,正如某位作家所言,wc,写的真tm牛逼!当然,也有我不太喜欢的故事,但是整体而言,瑕不掩瑜。《红唇绿嘴》、《火把与口哨》

2023-03-30 23:10:46 343

原创 读书笔记---月光落在左手上(余秀华)

虽然心里觉得作者有很艰难的经历,很优秀,但是看完之后还是非常压抑。当生活以痛吻你,要报之以歌,当生活以痛吻你,你扇他巴掌啊!希望作者是快乐的,但是我不希望我们是朋友。挺久买的这个本书,最近粗略看了一遍。要么改变,要么认命、

2023-03-30 22:56:48 253

原创 读书笔记--- ggplot2:数据分析与图形艺术

ggplot2:数据分析与图形艺术

2023-01-15 22:21:07 573

原创 读书笔记---Bioinformatics Data Skills

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2022-12-23 20:09:00 994

原创 R包WGCNA---转录组WGCNA共表达网络构建(基本概念)

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2022-11-06 23:29:33 1781 2

原创 读书笔记---蛤蟆先生去看心理医生

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2022-11-05 00:05:11 414

原创 Endnote X9文献管理器应用---使用总结

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2022-11-01 19:53:19 668

原创 R语言---Ubuntu中R语言更新至R4.2.1和R包devtools下载

R语言---Ubuntu中R语言更新至R4.2

2022-10-23 14:23:55 5465

原创 读书笔记---R数据可视化手册(R Graphics Cookbook)

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2022-10-21 15:55:06 346

原创 R语言---ggplot图片边缘空白设置和ggplot映射的shape值多余6个

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2022-10-17 22:41:48 4269

原创 Linux---sed使用记录

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2022-10-16 23:08:07 330

原创 Naopore基因组数据组装软件---NECAT下载试用

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2022-09-18 21:59:31 810

原创 基因组组装---Nanopore数据评估(nanoqc和NanoPlot套件工具)

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2022-09-15 23:02:51 3261 4

原创 R语言---PCA/tSNE/UMAP降维计算

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2022-09-14 23:06:28 5106

原创 R语言---scale函数,match函数和%in%详解

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2022-09-11 15:48:51 3597 4

原创 NGS基础---Plink文件格式ped/map和bed/bim/fam

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2022-09-08 23:35:41 8802

原创 R语言ggplot2添加单个文本或多个文本(包括公式)

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2022-09-08 10:23:04 12809

原创 R语言在散点图中添加lm线性回归公式

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2022-09-05 21:20:40 7679

原创 R语言ggplot2 title设置(main, axis 和 legend titles)

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2022-09-05 17:03:13 23402

原创 相关系数pearson、spearman、kendall和R语言中的cor/or.test()

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2022-09-04 21:48:22 4628

原创 Conda Error---AttributeError: ‘NoneType‘ object has no attribute ‘loader‘ for matplotlib

conda Error

2022-08-30 15:21:52 655

原创 基因组组装---基因组大小评估(genome survey)

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2022-08-29 22:29:57 6385

原创 Linux---cpu和核心数目查看

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2022-08-29 09:50:48 5176

原创 NCBI/BIG测序数据下载---通过Aspera下载拟南芥T2T原始数据

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2022-08-28 00:06:11 2666

原创 Naopore基因组数据组装软件---NextDenovo下载试用

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2022-08-27 21:45:09 1673

原创 Python tips---if、for、while均可与else构成整体条件语句

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2022-08-23 15:13:47 375

原创 Python tips---字典有序性

Python3.6版本后字典有序

2022-08-23 14:47:46 718

原创 Python tips---enumerate函数

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2022-08-23 14:10:40 273

原创 R包rdist、Python sklearn计算pairwise distance

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2022-08-07 23:16:25 1466 2

原创 R语言ggplot2循环中保存图片失败问题

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2022-08-02 21:24:05 2499

原创 Linux-Ubuntu Desktop主题安装

Ubuntu Desktop主题安装

2022-07-27 09:35:00 1097 1

原创 Linux-分屏软件terminator的安装配置

termonator分屏软件

2022-07-27 09:22:14 1018

原创 Linux-内网穿透frp-linux

frp内网穿透系统配置

2022-07-27 09:03:51 1432

原创 Linux-Ubuntu Desktop 18.04 LTS版本的安装(支持到2023年)

台式机ubuntu系统安装

2022-07-27 08:53:33 1217

原创 文献阅读---普通狗牙根阳江基因组单倍型解析与基因组稳定性和匍匐性研究

1)本研究对普通狗牙根的基因组进行测序和注释。组装后的基因组包含36条假染色体,包括37.91%的基因组大小的重复序列,并编码76,879个蛋白质编码基因。(2)多倍体C.dactylon基因组由来自两轮WGD事件的四种单倍型组成。尽管鉴定了一些单倍型特异性基因和转座子,但在四种单倍型中未检测到全局亚基因组优势。(3)成功确定了维持基因组稳定性的ZMM依赖性调节机制与分蘖角调节基因的协同进化。个人感觉,这个文章值得学习,文章方法步骤详实。...

2022-07-26 15:32:42 1965

原创 植物叶片叶绿素测定

测定叶绿素a(Ca),叶绿素b(Cb)和类胡萝卜素(Cx)的波长吸光度,可以通过公式计算得到Ca、Cb、Cx和叶绿素总浓度(Ct=Ca+Cb)的浓度。依据不同的物质的不同波长的比吸收系数,可以测定已知浓度的纯物质在不同波长的吸光度。植物叶绿素含量直接影响植物的光合作用和作物产量,是植物的重要的生理指标,与植物胁迫响应、逆境和衰老密切相关,也可以反应植物的生长发育情况。通常操作选取的叶片大概为0.1g,剪碎放入装有5ml95%以纯的10ml离心管中,暗处理24h,即可测量其吸光度。...

2022-07-18 15:04:56 18790 4

原创 PH测定仪、电导率测定仪、叶绿素荧光测定仪使用

该仪器使用时首先测定对照溶液的电导率S0,然后开始测量叶片样品在水中浸泡24h的电导率S1,最后将测量样品沸水浴30min,放凉至室温后,再次测量电导率S2。(5)测量后重复操作(1),并将探头放入CaCl2或KCl的饱和溶液中,用来保护pH测量仪探头的灵敏度。通常,可以使用数据线传输的,但是这个仪器存储功能损坏,因此只能拍照留存,手动输入到电脑中。操作步骤,使用仪器的叶片夹夹住待测叶片,暗处理15-20min,然后开始测量。将结果导出到自己的U盘中,清理电脑,检查酶标仪并清理干净,关机即可。......

2022-07-17 22:39:41 1526 1

原创 R语言---颜色选择和设置

在使用R绘图调色的时候,每次都要选择很久,有时候也会忘记相关的记录,特此总结一些自己常用的。

2022-07-15 11:27:38 24410 3

原创 文献阅读---优化RNA-seq研究设计以挖掘除草剂耐药性(综述)

英文题目:ReviewOptimizing RNA-seq studies to investigate herbicide resistance发表杂志:Pest Management Science发表日期:2017年12月研究单位:Department of Crop Sciences, University of Illinois, Urbana, IL, USA美国伊利诺伊州厄巴纳,伊利诺伊大学,作物科学系两点原因:(1)高通量的捕获能力(2)对无参考基因组物种具有对应的研究方法(1

2022-06-25 23:20:14 433

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