r语言绘制精美pcoa图_R语言绘制交互式热图

热图

通过热图可以简单地聚合大量数据,并使用一种渐进的色带来优雅地表现,最终效果一般优于离散点的直接显示,可以很直观地展现空间数据的疏密程度或频率高低。但也由于很直观,热图在数据表现的准确性并不能保证。

原理

生成热图需要四个基本步骤,即

创建缓冲区

填充缓冲区

缓冲区灰度叠加

颜色映射

其中颜色映射根据RGB三通道中的色带中映射后对图像重新着色,实现热力图

交互式热图

交互式热图绘制,分析数据相关性。

heatmap(热图)常用于高维数据的可视化。

数据集中的数据按照矩阵形式,编码为彩色的网格结构。热图常附有树状图。

热图应用领域很多,如基因、相关性、缺失值等。

heatmaply包

heatmaply包能够生成交互式地图,鼠标悬停可查看数值信息、拖动局部可放大查看。

e56821ee76bfc6d785b5318f691ca6df.png

载入相关包:

通过library函数将所需要的可视化包进行载入

首先分析所需要的相关包,然后进行载入,本项目中所用的包有:

dplyr

purrr

tidyr

tidybayes

gg

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