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RSS订阅原创 生物软件安装与使用--12 Annovar 的安装与使用
1 介绍可以对SNP和indel进行注释，也可以进行变异的过滤筛选2 安装# 解压缩 annovar.latest.tar.gz 文件到 ~/Biosofts/ 目录tar zvxf /disk1/shares/annovar.latest.tar.gz -C ~/Biosofts/# 运行 annovar 工具的 annotate_variation.pl 脚本~/Biosofts/annovar/annotate_variation.pl# 将 annovar 目录添加到 PATH
2023-11-27 17:07:51
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原创 生物软件安装与使用--11 bcftools 的安装与使用
bcftools 是一个用于操作和处理 VCF/BCF 文件的软件工具集。它是 samtools 工具集的一部分，用于对比对后的 BAM 文件进行 SNP 和 Indel 的检测。bcftools 可以用于 SNP 和 Indel 的过滤、注释、统计和可视化等操作。
2023-11-27 16:54:11
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2原创 生物软件安装与使用--2FastQC
1 简介作用：FastQC 可以快速多线程地对测序数据（基因组测序、ChIP-Seq、RNA-Seq、BS-Seq等）进行质量评估（Quality Control）。Fast文件展示2 软件安装。
2023-11-27 13:01:00
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空空如也
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