Error in library(DESeq2) : 不存在叫‘DESeq2’这个名字的程辑包

Error in read.dcf(file.path(pkgname, "DESCRIPTION"), c("Package", "Type")) : 
  无法打开链结
此外: Warning messages:
1: In download.file(url, destfile, method, mode = "wb", ...) :
  downloaded length 1486848 != reported length 4243023
2: In unzip(zipname, exdir = dest) : 从zip文件中抽取1时出了错
3: In read.dcf(file.path(pkgname, "DESCRIPTION"), c("Package", "Type")) :
  无法打开压缩文件'Biobase/DESCRIPTION',可能是因为'No such file or directory'

在安装‘DESeq2’这个包的最后出现上面的错误。可以看出是‘Biobase’这个包有问题。重新安装此包后,再一次安装‘DESeq2’,安装成功。

library('DESeq2')出现下面问题:

载入需要的程辑包:GenomeInfoDb
Error: package or namespace load failed for ‘GenomeInfoDb’ in loadNamespace(i, c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[i]]):
 不存在叫‘GenomeInfoDbData’这个名字的程辑包
错误: 无法载入程辑包‘GenomeInfoDb’

缺少GenomeInfoDb包,继续安装

'GenomeInfoDbData'这个包一直能完整下载,但是安装出错

于是,先把'GenomeInfoDbData'本地下载下来,再用R进行本地安装,安装成功

library(DESeq2)

成功

 

tip:包安装不成功可能原因

1.依赖包没有安装,先安装依赖包

2.下载包时,网速不行,安装出错。用浏览器下载,之后本地安装

3.R的版本不对,检查对应的版本

 

转载于:https://www.cnblogs.com/zhengzh/p/7992625.html

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