安装DESeq2时遇到的错误

最新推荐文章于 2025-02-20 18:56:59 发布
最新推荐文章于 2025-02-20 18:56:59 发布
阅读量8.5k 收藏 8
点赞数 9
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/weixin_43915091/article/details/109299880
版权 
options(BioC_mirror="http://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")
BiocManager::install("DESeq2")

改了镜像之后安装成功
中途提示缺少什么包时手动安装

library(DESeq2)

报错
Error: package or namespace load failed for ‘GenomeInfoDb’ in loadNamespace(i, c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[i]]):
不存在叫‘GenomeInfoDbData’这个名字的程辑包
错误: 无法载入程辑包‘GenomeInfoDb’

BiocManager::install("GenomeInfoDbData")
lmlxiaoai
关注
R下载安装WGCNA
m0_63768606的博客
03-20 9953
记录并总结自己学习过程遇到的问题 刚开始学习WGCNA 在学习了相关的原理之后 想要按照官网的教程走一边 理解其中的代码 一 刚开始就遇到了这样的问题，没办法下载WGCNA包 Error: package or namespace load failed for ‘WGCNA’ in loadNamespace(i, c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[i]]): 不存在叫‘GO.db’这个名字的程辑包 然后我尝试下载这个包 包括在Bioc...
r语言Error: package or namespace load failed for ‘dplyr’ in loadNamespace(i, c(lib.loc, .libPaths()报错。
m0_59917021的博客
09-26 2万+
Ｒ语言，导入数据挖掘包报错
Error: package or namespace load failed for ‘caret’ in loadNamespace(i, c(lib.loc, .libPaths())解决方法
m0_74838098的博客
10-15 1126
别忘了点击OK和Applay最后一步：重启Rstudio就可以看见图1变成图2（版本由4.2.2变成4.4.1）图1图2当然，解决了这个，文章前言提到的报错问题也就不复存在了~~~
出错记录：Error: package or namespace load failed for ‘DESeq2’：没有这个DLL ‘BiocParallel’：是不是没有为此架构安装？
weixin_40640700的博客
03-15 3924
出错记录： Error: package or namespace load failed for ‘DESeq2’ in library.dynam(lib, package, package.lib): 没有这个DLL ‘BiocParallel’：是不是没有为此架构安装？ 解决策略：强制重装缺失的那个R包。 BiocManager::install("BiocParallel",force = TRUE) ...
R语言安装DESeq2包
最新发布
riri04721的博客
02-20 311
可以点击链接跳到官网，找到installation部分，复制代码到Rstudio进行安装。
关于安装DESeq2的错误，不存在GenomeInfoDbData
suiyue17的博客
02-24 6991
今天想用DESeq2来分析rna-seq的数据，然后死活安不上这个R包，老是提示这样的错误。 在网上试了各种方法都行不通，包括install.packages，和下载R包后自己手动安装都无法解决，当我使用这两个方法后，他会提示这个包处于非零状态。（忘记截图了大概是had non什么的） 我还尝试重新安装了R语言和Rstudio，仍然不起作用。最后我在R语言和Rstudio的安装目录里发现了卸载按钮，卸载了我的R语言和Rstudio，并且删除了相应的文件夹，保证彻底删除。然后我再重新安装，重新打开后终于.
DEseq2安装失败
09-20
如果你在安装DESeq2时遇到问题，可能是由于多种原因： 1. **依赖库缺失**：DESeq2需要R语言及其一些特定的依赖包，如BiocManager、GenomicRanges、S4Vectors等。检查你的环境中是否已经安装了所有必要的组件。 2. ...
r包deseq2因为版本问题下载不了怎么办
09-06
如果由于版本问题无法下载R包DESeq2，可以尝试...如果以上方法仍然无法解决问题，可以尝试搜索与你使用的R和DESeq2版本相关的错误信息，或者在相关论坛或社区中询问其他用户是否遇到类似的问题，并且寻求帮助和建议。
求助DESeq2安装问题
2301_76497647的博客
02-13 1656
求助DESeq2安装问题
BiocManager安装R包失败——Bioconductor version cannot be validated
wyhua2008的博客
07-29 2431
最近因为需要安装ChIPseeker这个R包，需要使用BiocManager进行安装。前言1. 报错内容2. 解决方案3. 安装R包模板3.1 镜像设置3.2 下载方式设置3.3 安装R包4. 永久保存镜像设置后记。为了更方便的安装R包，不用每次都进行设置。这样以后我们一旦打开R软件，这些代码就会自动运行一次，我们就可以愉快的安装R包了。代码语言：javascript。代码语言：javascript。代码语言：javascript。代码语言：javascript。代码语言：javascript。
Error in DESeq(dds) : 不是所有的is(object, “DESeqDataSet”)都是TRUE tximport
09-14
`Error in DESeq(dds) : 不是所有的is(object, “DESeqDataSet”)都是TRUE` 这个错误通常发生在使用`DESeq2`包进行差异表达分析时，传入`DESeq()`函数的`dds`对象不符合预期的类型。`DESeqDataSet`是`DESeq2`包中...
Error: package or namespace load failed for ‘ggplot2’ in loadNamespace(i, c(lib.loc, .libPaths()), v
data+scenario+science+insight
02-05 1万+
Error: package or namespace load failed for ‘ggplot2’ in loadNamespace(i, c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[i]]): 载入了名字空间‘ellipsis’ 0.3.1，但需要的是>= 0.3.2
RNA-seq流程学习笔记（3）-Linux系统中安装miniconda、设置清华镜像源、安装RNA-seq相关软件、删除环境
垚垚爸的博客
05-22 6598
主要参考文章： Anaconda介绍、安装及使用教程 conda的安装与使用（2019-6-28更新） Anaconda查看、删除、增加channel Anaconda查找源及配置清华镜像 Miniconda官网 今天开始在服务器上开了一个用户名，所以要重新弄一下所有设置，就从使用Conda开始记录一下，方便以后再搬家时自己查找学习。登录服务器使用的是MobaXterm软件，因此是在Windows环境下通过该软件进入Linux的服务器，很多操作比自己之前用的虚拟机更方便，但可能不是完全的Linux系统，不知
R运行错误：Error: package or namespace load failed for ‘rJava’:
热门推荐
Peter_Bell的博客
11-20 3万+
R语言中的JAVA环境
Error in library(DESeq2) : 不存在叫‘DESeq2’这个名字的程辑包
weixin_30379531的博客
12-06 9919
Error in read.dcf(file.path(pkgname, "DESCRIPTION"), c("Package", "Type")) : 无法打开链结 此外: Warning messages: 1: In download.file(url, destfile, method, mode = "wb", ...) : downloaded length 14...
评论 5
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值