go操作excel方便么_Go（Gene Ontology） analysis——“生信分析”基础四

Question：

在前一期内容中，小桦同学利用DAVID数据库成功地将差异基因富集到相关的GO Term和KEGG Pathway上，并将结果下载保存（.txt），那么如何让这些结果以图像的方式直观地呈现出来？

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其实我们在文献中经常可以看到GO analysis和KEGG Pathway相关的图，只是之前没太留意。如图1和图2所示，通过观察，我们可以发现两幅图的共性：纵坐标显示为不同的通路或者生物功能，横坐标为-log10（FDR）或-log10（p-value）。其中FDR全称为False discovery rate，反映的是检验中假阳性率的概率。简单来说，FDR就是利用某种检验方法（Benjaminiand Hochberg法）对p-value校正后的结果。除开单纯的统计讨论，我们在文献中看到的FDR，q-value，adjusted p-value可以近似理解为完全相同的概念。

图1 引自Beige Adipocyte Maintenance Is Regulated by Autophagy-Induced Mitochondrial Clearance, 2016, Cell Metabolism