chemdraw怎么连接两个结构_科研小站 | 化学结构绘图必备软件——ChemDraw了解一下...

本文详述了ChemDraw的使用方法,包括创建单键、双键,添加标签,复制与排列结构,绘制反应式及添加箭头等步骤,帮助化学研究人员掌握这款化学结构绘图软件。

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化学结构绘图必备软件 —— 

ChemDraw了解一下

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e7fdf48b5d6fe9198cc41258906098c0.png 软件简介 ChemDraw是由CambridgeSoft公司制作的ChemOffice系列软件,是目前国内外最流行、最有应用价值的化学绘图软件,可以快速、精确地绘制化学结构,是各期刊指定的化学结构绘图格式软件。其功能十分强大,除了可以即时画出任何有机物分子之外,还可以建立和编辑各类分子式及分子模型、方程式、结构式、立体图形、轨道、实验装置等。

(软件官网https://www.cambridgesoft.com)

一、软件的工具栏界面

常用的Chemdraw工具栏有Main Tools(主要工具栏)、General ToolBar(普通工具栏)、Style ToolBar(格式工具栏)、Object ToolBar(对象工具栏)。这些工具栏均可以通过点击界面上方的【View】查看,其中主要工具栏最为常用,基本可以满足各类图形的绘制。

43ffee2b7cc1eefa423431e3017158e6.png 主要工具栏介绍大全

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二、接下来在这里主要介绍一些使用频率比较高的菜单

①FILE(文档)菜单

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除了对文件的操作,还有结构式的各种样式的设定、操作页面扩展等,例如: Page Setup ( 页面设置 ) 、 Print ( 打印 ) 、 Document Settings( 文档 设定 ) 、 Apply Document Setting from( 从应用文档设定 ) 、 Preferences( 参 数选择 ) 、 ListNicknames( 俗名列表 ) 、 Exit ChemDraw Ultra ( 退出 ) 等。b68dc223b85f78a96c96cb160c3a3474.png

②EDIT(编辑)菜单

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关于复制、修改与一些图片等等的插入。 Undo ( 撤销 ) 、 Redo( 重复 ) 、 Cut ( 剪切 ) 、 Copy( 复制 ) 、 Paste ( 粘贴 ) 、 Clear( 清除 ) 、 Select A11( 全选 ) 、 Repeat List Nicknames( 重复列俗名列表 ) 、 Copy As( 复制为 ) 、 Paste Special ( 特殊粘贴 ) 、 Get 3D Model ( 获得 3D 模型 ) 、 Insert File( 插入文件 ) 、 Insert 0bject ( 插入对象 ) 等选项。

③VIEWS(视图)菜单

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用于切换各种工具窗口的开/ 关。 Show Crosshair( 显示交叉线 ) 、 Show Rulers( 显示标尺 ) 、 Show Main Tools( 显示主要工具 ) 、 Show General ToolBar ( 显示普通工具栏 ) 、 Show Style ToolBar( 显示格式工具栏 ) 、 Show Object ToolBar ( 显示对象工具栏 ) 、 Show Analysis Window ( 显示分析窗口 ) 、 Show Chemical PropertiesWindow ( 显示化学性质窗口 ) 、 Show Info Window( 显示信息窗口 ) 、 Show PeriodicTable Window ( 显示周期表窗口 ) 、 Show Character Map Window ( 显示字符集窗口 ) 、 other Toolbars ( 其他工具栏 ) 、 Show Chemical Warning ( 显示化学警告 ) 、 Actual Size( 实际大小 ) 、 Show Document ( 预览文档 ) 、 Magnify ( 放大 ) 、 Reduce ( 缩小 )

④OBJECT(对象)菜单

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用于多个化合物之间的位置关系的调整,以及化合物的一些修饰美化等。 0bject Settings ( 对象设定 ) 、 Apply ObjectSettings from( 应用对象设定 ) 、 Fixed Lengths ( 固定长度 ) 、 Fixed Angles ( 固定角度 ) 、 Show Stereochemi stry ( 显示立体化学 ) 、 Center on Paper( 居中 ) 、 Align( 对齐 ) 、 Distribute ( 分布 ) 、 Add Frame ( 增加帧 ) 、 Group ( 组 ) 、 Ungroup( 取消组 ) 、 Join( 联合 ) 、 Bring to Front( 置为前方 ) 、 Send to Back ( 置为后方 ) 、 Flatten( 平滑 ) 、 F1ip Horizontal ( 水平翻转 ) 、 F1ip Vertical ( 垂直翻转 ) 、 Rotate 1800Horizontal ( 水平旋转 180o) 、 Rotate 180 o Vertical ( 垂直旋转 180 o) 、 Rotate( 旋转 ) 、 Scale( 比例缩放 )

⑤STRUCTURE(结构)菜单

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针对画好的结构式为对象的一些操作。 Atom Properties( 原子属性 ) 、 Bond Properties( 键属性 ) 、 Bracket Properties ( 括号属性 ) 、 Check Struc ture ( 检验结构 ) 、 CleanUp Structure ( 构建结构 ) 、 Expand Label ( 扩展标记 ) 、 Contract Label ( 收缩标记 ) 、 Expand Generic Structure( 扩展 - 般结构 ) 、 Add Multi-CenterAt tachment ( 增加多中心附件 ) 、 Add Variable Attachment ( 增加可变的附件 ) 、 Add3D Property ( 增加 3D 特性 ) 、 Map Reaction Atoms ( 绘制对应的反应原子 ) 、 ClearMRReaction Map ( 清除对应的反应原子 ) 、 Predict 1H, NMR Shift ( 预测 1H, N 谱图 ) 、 Predict 13C, NMR Shifts( 预测 13C, NMR 谱图 ) 、 MakeSpectrum- Struc ture. Assi gnment ( 分配光谱结构 ) 、 Define Nickname( 定 义俗名 ) 、 Convert Name to Structure ( 将名字转化为结构 ) 、 Convert Structure toName ( 将结构转化为名字 ) 等选项。 其他比如 Text 、 Curves 、 Colors 、 Help 等菜单选项,就如同字面意思一样,比较容易理解,功能也没那么多,这里就不多做介绍了。 e7fdf48b5d6fe9198cc41258906098c0.png

三、接下来看一下chemdraw的高级技巧吧!

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四、最后来看一下chemdraw的应用实例——利用ChemDraw化学公式编辑器,绘制化学反应式

★创建一条单键:选定实心单键工具,把指示器(+ )定位到文档窗口的任何位置,然后点击。单键以固定角度-30度,固定长度显示。

★添加第二条键:将指示器指向右边的原子,点击原子以加一条键。 这条键和第一条键之间夹角120度。注意:添加键的角度可以在Drawing Settings 对话框 利用Chain Angle setting设置。

★添加第三条键:按照以上方法添加第三条键,完成后如下图所示:

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★改单键为双键:点击中间的原子,按下鼠标, 按照下图方向拖动鼠开鼠标。

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★向结构中添加标签:用指示器(+)指向双键上方的原子,双击该原子,在出现的文本框中输入大写字母“O”,然后可以通过点击别的区域和选择别的工具关闭输入文本框。 

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接下来,利用复制这个结构,并利用复制品创建一个新的结构。

★复制结构:选择套锁工具,所绘结构会被自动选取。指向选择框,按下Ctrl键,向右侧拖动选取框。就会复制出一个结构。

修改复制结构:选择实心单键工具,指向复制结构右下方的原子,单击。并在同一个原子上多次单击以添加多条键。完成图如下:

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注意:多次单击不可过快,否则,框。应在单击之间稍做停留。

选择要添加的标签的原子,在“OH”。

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★排列结构:会出现文本上面输入选择两个结构,在Object菜单下,指向 Align,并选择 T/B centers,将两个结构对齐。结果如下:

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★接下来,使用不用的方式选择结构,并将两个结构分开一定的距离以添加箭头: 选择选取框工具,最后一个绘制结构会被选择。按下Shift 键以保持结构的整齐,并拖动选取框至右边。 

★向反应式中添加箭头:点击箭头工具以显示箭头模板。选择箭头后,松开鼠标。指向第一个结构的后方,并按下鼠标,拖动箭头至你想要的长度,然后松开鼠标。

注意:在箭头工具右下方的三角形说明该图表包含有模板内容。

★如果你想改变箭头的长度和箭头与X轴的夹角,可以这样:1.按下 Shift键并指向箭头,这时,一个高亮的框将会出现,如果你选择正确的对话。2. 拖动箭头至你所想要的长度和角度。利用文本工具在添加反应条件与催化剂: 选择文本工具,指向箭头上方,单击插入文本框,在出现的文本框中输入OH,完成如下图:

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注意: 如果你想重新放置文档,可以利用选择工具然后拖动该说明。 利用在化学符号工具模板中可用号加一个电荷符号:

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★选择化学符号工具,选择环型负电向“OH”的中间,并单击放置电荷工具。 注意:如果你在放置符号之后,按着鼠标,就可以沿着符号通过拖拉将其旋转到固定位置。从化学符号模板中添加的符号自动和离他们最近的结构相结合。一些诸如箭头之类的符号不能自动结合,使用者可以使用群组命令手工合并这些符号。 

★为了组合符号:点击选择工具—套锁或者选取框。按下Shift键的同时,点击箭头 ,OH 标签和电荷符号。在Object菜单中选择Group就可以组合这些目标。

注意:如果你按着“Shift”点击一个已被选择的目标,则该目标可以取消选择。 你可以通过在一个群中点击单个的物体来选择。

★利用文本工具可以创建包括反应物的名字说明:工具,指向第一结构的下方,单击创造一个“Text”菜单中选择“Centered”命令,在鼠标会移到文本框的中间,然后输入文本2-propanone

,点击 “Enter or Return”按钮可以输入新的一行。 然后输入“2 moles”

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★为另一个结构创建一个平行的说明:先放置一个文本框,然后输入4-hydroxy-4-methyl-2-pentanone, 和1 mole。 最后,为了完成方程式,我们给方程式一个阴影框:选择“绘制元素”工具,从模板中选择阴影框, 如下图所示圈出阴影范围。 

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★然后,将文档存盘就完成了。最后结构如下:

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图文来源: Chem-Station化学空间

编辑:韩改田

审核:李昕茹 张琪 董朝

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