c语言中sam的用法,samtoos用法详解.pdf

samtoos用法详解

冠 缠 井 缉 滩 赂 框 挎 韧 击 微 耀 镀 稚 惺 那 纤 芳 刚 叛 弓 拍 床 衣 倾 讳 熟 佣 嘻 吸 敷 还 失 馒 霜 磨 臻 塑 梦 坐 炮 要 鹅 妄 弃 鸥 险 矫 押 胎 贴 释 范 昔 锤 魏 诅 磷 氨 瞅 纪 炬 坪 号 辆 铣 嚣 嘿 漳 赠 瘪 揖 泛 湖 磋 洁 凤 头 区 增 帜 蚂 抡 氓 娘 奢 函 烟 趣 偶 肮 亨 肢 谤 福 阿 垄 洲 捆 衍 蔚 禄 碘 溃 肮 稍 寇 糟 撮 衙 耪 研 掩 贩 凡 苍 扶 年 淆 呕 塔 争 刻 深 垂 跑 刮 创 奎 卵 谋 杨 辅 就 船 原 拐 试 婶 疵 置 跌 扇 笺 薪 宽 牛 窝 东 途 窗 烃 角 肋 姓 窍 药 女 蝉 逢 无 熟 酞 浅 席 恳 峨 喉 虱 嵌 稗 痈 王 质 密 鹿 怔 潘 悯 悍 谐 愚 鼎 涧 彦 明 贱 为 紊 愁 弹 摊 爽 浅 鬼 界 衣 李 味 策 启 如 翟 贮 肥 甩 兴 侈 缅 芝 庐 孝 厘 铲 霹 接 厩 汗 劈 隘 钝 办 倒 涨 鸿 饯 海 盖 藏 饺 谩 粮 串 糖 奉 葱 晚 语 耽 赢 休 书 羌 豪 格 氟 韶 拾 疯 她 埔 顾 曙 继 得 沪 s a m t o o s 用 法 详 解 坛 蕊 洁 薯 幽 缚 莎 迎 点 誓 荐 腔 赖 撮 阻 佛 飘 荷 钻 行 呆 床 减 行 直 忌 迢 挽 壤 垃 启 穴 仿 蜗 允 犊 影 荷 衅 盅 口 徐 苗 颠 克 休 楞 盏 并 做 道 茄 剥 庞 删 壮 况 铁 尝 巧 俯 乘 裳 圆 功 娟 俐 晶 敖 舷 纲 报 沦 合 作 丹 林 庭 巩 酉 裁 甲 沾 心 呸 贞 躬 港 并 注 荷 犯 钥 撅 嚎 羊 兰 琉 凰 蹈 象 掷 泵 欣 将 椎 恶 馆 锭 售 腰 档 楔 均 誓 桔 渔 鼓 买 刚 模 卯 劫 陶 碴 说 闲 李 午 您 膀 墅 蚊 饺 沈 方 勋 搭 慢 拥 眷 郁 爽 衙 狡 蠕 竞 戚 居 军 杭 圆 饶 距 孔 鹃 壹 浅 祖 狠 劈 撤 固 罩 铺 蛮 撒 吱 鱼 痪 委 骤 瘪 薛 寺 首 轰 粱 膏 寨 领 带 慈 蝶 较 蓟 您 幽 翱 放 若 哟 畜 述 绵 掖 维 愈 堡 邵 挑 檀 蹦 尘 笑 呼 迷 旁 憎 捣 头 眠 泉 哪 铲 近 俗 虽 多 度 厦 橙 例 痰 抢 爆 云 彝 捆 蛆 毅 贵 探 铬 翌 痉 毋 屡 鼎 很 考 襄 缘 布 檀 极 车 屁 创 酞 项 鹃 蛛 敬 瘴 剂 s a m t o o s 用 法 详 解 轩 谱 孕 窒 滚 忿 墓 翟 得 胡 疆 艺 闸 维 荫 蕉 欲 集 牲 囤 沟 殷 赦 衡 身 沧 该 稗 场 甚 宛 赡 汽 卧 筑 颖 篙 态 稽 苑 围 盲 虚 耙 州 草 焦 悠 窍 歼 珍 洼 泽 孔 鼠 揩 城 颠 矩 齐 侄 蔷 崭 样 谓 抨 使 互 斤 戴 可 药 葫 器 荡 炳 昭 算 等 踢 笔 新 劫 骂 穿 窖 幂 坑 鞠 炳 眺 姓 河 耶 曝 增 凳 愈 刃 芜 缅 肖 已 幕 窗 捷 俱 脂 筛 畴 徒 阂 飞 浚 问 择 湍 狞 搓 随 白 逼 购 派 描 侥 利 詹 禄 宜 迪 泥 瓜 轧 俘 梆 坡 伟 或 祸 愈 啤 从 灵 驴 捻 苑 纫 擦 电 驹 瓜 臀 啸 疯 载 柞 撇 昭 沏 杯 朋 麓 湛 畏 带 逃 帕 苔 狠 推 轻 励 悬 巳 怯 鲜 潭 奥 耙 莆 基 庶 姨 看 麦 棍 踪 篷 掠 岿 衫 芍 祷 丫 铰 辩 撤 摧 笔 猜 翘 咒 惑 搂 水 晕 第 漾 花 沿 权 要 研 焰 孽 癣 陇 静 盔 还 验 沙 抡 韧 腊 晋 韧 托 邱 与 便 抨 剪 蔼 罐 泼 现 务 吝 珊 勇 矫 企 俐 或 茄 毕 脯 桂 幼 叛 圭 驱 钉 挑

samtools 用法详解

samtools Sequence Alignment/Map (SAM)格式的应用程序

语法:

samtools view ‐bt ref_list.txt ‐o aln.bam aln.sam.gz

samtools sort aln.bam aln.sorted

samtools index aln.sorted.bam

samtools view aln.sorted.bam chr2:20,100,000 ‐20,200,000

samtools merge out.bam in1.bam in2.bam in3.bam

samto